Click here to close
Hello! We notice that you are using Internet Explorer, which is not supported by Echinobase and may cause the site to display incorrectly. We suggest using a current version of
Chrome
,
FireFox
, or
Safari
.
Echinobase
???banner.login???
???banner.register???
Contact Us
Cite Echinobase
Genes
People
Labs
Organizations
Paper Authors
Paper Titles
Echinobase Accession
Anatomy Items
Disease Ontology
OMIM Diseases
GO Terms
Genes
People
Labs
Organizations
Paper Authors
Paper Titles
Echinobase Accession
Anatomy Items
Disease Ontology
OMIM Diseases
GO Terms
BLAST
Echinoderm mRNA
Echinoderm protein
Echinoderm CDS
S. purpuratus (
Purple sea urchin
) 5.0
L. variegatus (
Green sea urchin
) 3.0
P. miniata (
Bat star
) 3.0
A. planci (
Crown-of-thorns
) 1.0
L. pictus (
Painted urchin
) 2.1
A. rubens (
Sugar star
) 1.3
A. japonica (
Feather star
) 1.0
Genomes
Download Echinoderm Genomes
S. purpuratus (
Purple sea urchin
) 5.0
L. variegatus (
Green sea urchin
) 3.0
P. miniata (
Bat star
) 3.0
A. planci (
Crown-of-thorns
) 1.0
L. pictus (
Painted urchin
) 2.1
A. rubens (
Sugar star
) 1.3
A. japonica (
Feather star
) 1.0
JBrowse2 Tracks
Genes
Gene Search
Gene Search Tips
Gene Nomenclature Guidelines
Gene Name Questions
Expression
Search Anatomy Items
Quantitative Expression Datasets and Plotting Tools
Anatomy & Development
Search Diseases
Echinobase Anatomical Ontology (ECAO)
L. variegatus
Atlas of Development (pdf)
Resources
Protocols, Reagents and Data on EchinoWiki
Resource for Developmental Regulatory Genomics
Davidson Lab Gene Regulatory Networks
Libraries, Vectors and Screening
BAC Table
???header.navigation.searchAntibodies???
???header.navigation.searchMorpholinos???
Guide RNAs (gRNA)
Cis-Regulatory Elements (CREs)
Literature
Papers
Books
Cite Echinobase
Community
Find People
Find a Lab
Organizations
Job Postings
Downloads
Data Download
Gene Page Reports
Browse Download Site
BLAST Databases
???blast.header???
Download BLAST databases
???blast.alignment???
???blast.program.blastn???
???blast.program.blastp???
???blast.program.blastx???
???blast.program.tblastx???
???blast.program.tblastn???
???blast.database???
-- Genomes --
Strongylocentrotus purpuratus 5.0 Genome
Strongylocentrotus purpuratus 3.1 Genome
Lytechinus variegatus 3.0 Genome
Patiria miniata 3.0 Genome
Acanthaster planci 1.0 Genome
Lytechinus pictus 2.1 Genome
Asterias rubens 1.3 Genome
Anneissia japonica 1.0 Genome
-- mRNA --
Echinoderm mRNA
-- CDS --
Echinoderm CDS
-- Protein --
Echinoderm Protein
???blast.query???
>XP_038044602.1 mucin-2-like isoform X1 [Patiria miniata] MIALCVSLEAYARVCASQNVVLNWRSEDLCPKQCPDTQVYTECGTLCPPTCTSANTDHCPADCVSGCQCP QGTVLEDGRCVDVEECPCVHNREKYPPGATVSVKCNTCTCHSGKWSCSNDVCQSTCHVVGDPHYLTFDKK KYTFMGHCRYMLVEDYVDGTLSIIGENQNCGSGHSVTCTKAVVVKVNNTEVYLKQGKEVDVNGVHIKPPF VNQHVSIRRGSSKFLILETFGMSLKWDGIDRLYITLAPSYMNKVRGLCGTFDSNQNNDFMTPAGDVETNK IAFTNKFVVDPGCFEPETTVSLPPCSLNSHMATFAEAKCGIMNSDVFRACHGSVSPDLFYDICMYDVCGC DTAFTTSCLCESIAGYAMECANEGIFIDWREHELVAKYCDVSCPGSQVYSTCGPTCGQSCRDLSLACIET DYCVEGCNCPEGSVLDDDGNCISPSQCPCYWDDQVFSPGTEMERSCLTCTCVNGTFDCIGEECNETIICP NNQIFDNHATPCPVTCDNLDHYRPCVASTRPGCMCPEGYVLEDDICILPSECPCYHSGHSYQHGEMLQID ACNQCVCKGTMWECTHKVCPAVCSAVGEGHYTTFDGRMYSFVGDCRYTLAQSINNTFSIEVENVVCGSSG ITCTRAIEVNIGDYVSIFLVRGGEVMINEVKVQLPKHYYSLQIEKSGFFYTITSDIGLRVLWDGGTRVYV EVQPHFGGQLSGLCGNFDGNQENDFTAWNGGLEQSADNFANSWKVSAGCPELYQEDVLHPCTVNGHREAW ANRRCNILMQSTFEPCHAHVDPSPYLENCIFDSCGCDMGGDCECMCTAIAAYAMECSQSGVHIKWRSQDL CAIQCEYGFEYSACGPSCQETCQTIGDEKPEYCNGCVEGCHCPEGMVVQDGGCVPADECPCYHGNTEYPP GTIISKECQNCTCVRGKFNCLGEPCNITCSDHQYQCDNDECIPAGWTCDGENDCSDGSDEIDCVYTCSSD QYTCGNGHCIDASFYCDGAQDCDDNSDEVDCPLPSCYGGEFQCNNGKCISRAFVCDGDLDCGFNDPADEE NCQTTTAYSNATVTAHTTTLQETTDAYTTPSYACSPDEFTCKNGLCVSGGSNGSVCNGINDCGDSSDEEY CGTTPHPLQTTTVIGCLISQWRCTNTSQCIHSSYRCDGVPDCEDASDELNCVYSTSKPMTTQPNLPYITT SPSYIQETSSQPGTTVLSTKPYTPNISPLPGTSTPIPYETSTLERYTTKAVVTPVSQNYIGTTQSPTTPY VTQATTKLVTAIPPSVASPPQVEITTPYLKVLTTPYMTTPHLPPATTPYVPVVTSPYMPEETTPYLPKET TTYIPEVSTPYIPVATTQYVPPLTTPYVPEVTTPYVPPVTTPYVPEVTTQYLPKVTTPYIPEVTTPYLPE VTTPYAPVVTTPYMQLVTTPYMPVITTPNVPAVTTPYVPEVTTPDLPEVTTPYLPEVTTPFLPEVTTTYV PAVTTPYIPEVTTPYVPPVTTPYVPELTTQYLPKVTTPYVPEVTTPYLPEVTTPYAPVVTTPYMQLVTTP YVPVITTPNVPAVTTPYVPEVTTPYLPEVTTPYLPQVTTPYVPAVTTPYRPEMTTRYISRVTTTHMPMVT TPYVQVMTTPQTTAYVVPGTSTPLPLEQSTVGSSTTQSVLSPTSPASYIQTSPTFPPTKSVTDLKELHPP TVVATYVPPYVTTPQALKPTTRNVPYITTQYVPEVTTPYVPAVTTPNVPAVTTPYVPKVTTPYVPEVTTP YLPAMTTPYLPEVTTPYMPEVTTAYVPEVTTPNVPAVTTPYVPKVTTPYVPVVTTPYVPVVTTTYLPEVT TPYLPEVTSPYLQEVTTPYVPEVTTPYVPEVTTPYVPEVTTQYLPQVTTPHVPAVTTPNVPALTTPYVPK VTTPYVPEVTNPYLREVTTPYLPEVTTPYVPEVTTPYVPLVTTPYLPQVTTPYVPAVTTSNVPAVTTPYV PKVTTPYVPEVTTTYLPVVTTPYLPEVTTPYVPEVTTPYLPEVTTPYAPVVTTPYMQLVTTPYMPVITTP NVPAVTTPYVPEVTTPYLPEVTTPYLPQVTTPYVPAVTTPYRPEMTTRYISRVTTTHMPMVTTPYVQVMT TPQTTVYVVPGTSTPLPLEQSTVGSSTTQSVLSPTSPDSYIQTSPTFPPTKSVTDLKELHPPTVVATYVP PYVTTPQALKPTTQNVPYITTPYVPEVTTPYVPEVTTPYLPQVTTPYFPAVTTPFLPAMTTPYMPEATTP YVPKVTTPNVPAVTTPYVPKVTTPYVPEVTTTYLPEVTTPYLPEVTTPYLQEVTTPYVPEVTTPFVPEVT TPYLPQVTTPYVPAVTTPYVPKVTTPYVPEVTTPYLPEVTTPYLPEVTTPYVPEVTTPYVPEVTTPYVPA VTTPYVPKVTTPYVPVVTTTYLPEVTTPYLPEVTTPYVQEVTTPYVPEVTTPYVPEVTTPYVPEVTTPYL PQVTTPYVPAVTTPNVPAVTTPYVPKVTTPYVPEVTTTYLPEVTTPYLQEVTTPYVPEVTTPYVPLVTTP YLPQVTTPNVPAVTTSNVPAVTTPYVPKVTTPYVPEVTTPYLPEATTPYVPKVTTPYVPAVTTPYLPAMT TPYLPAVTTPYVPKVTTPYVPVVTTPYQPEVTTPYIPEVTTPYVPAVTTPYLPELTTPYLPAVTTPYLPE VTTPYIPPVTSEVVYTSTPYYRTREPESCPFSYTLIDELILQPTSFNASSTEPGNSPANVRLDQLKRSTY IAWAPATDDQGPSVTVDLGSEKIINGLSVQGGGFGTDEFVTLFSVSYSVGGQDYTPVETSDWDDAVFEGN SDDHTIQTDPLPVPIVARYIKISVVEYHGGVRLRCAILGCDLYLDYTSPAASTTVVTTPSGTTPSTCQPG QFQCSSGICINAGPGGQLCDGINDCGDYSDEKGCGTTVPPTATDKMTSPYKAVTTPYLQEVTTQYLPAVT TPYVPDVTTTYVPAVTTPYVPEVTTPYVPAVTTPYVPVVSTPYVPAVTTPYVPEVTTPYGPAVTTPYVPE VTTPYVQAVTTTDVSEVTTHYIPGVTTPRVQVTTPNVPVTTSKTRETTEYSIPGTSTPIPLEQTTVKRST TQSPLSPTSPSSYFQTLPTFPPTKSVTDLKELHPPTVVATYVPPYVTTPNILKPTTPSIPYITTPYVPEV TTPYVPAVTTPYVPEVTTQYVPVVTTPYVPEVTTQYVPVVTTPYVAEATTPYVPAVTTPYVSGVTTPYVP EVTTQYVPVVTTPYVAEATTPYVPAVTTPYVPGVTTPYVPAVTTPYLPQVTTPYVPEVTTPYVPEVTTTY LPEVTTPYLPEVTTPYVPEVTTPNVPAVTTPYVPEVTTPYVPEVTTPYVPEVTTPYLPQVTTPYVPAVTT PNVPAVTTPYVPKVTTPYVPEVTTTYLPEVTTPYLPEVTTPYLQEVTTPYVPEVTTPYVPEVTTPYVPEV TTPYLRQVTTPYVPAVTTPNVPAVTTPYVPKVTTPYVPEATTPYVPEVTTPFLPQVTTPYVPAVTTPNVP AVTTPYVPKVTTPYVPEVTTTYLPEVTTPYLPEVTTPYLQEVTTPYVPEVTTPYVPEVTTPYVPEVTTPY LPQVTTPYVPAVTTTYLPEVTTPYVPEVTTPYVPEVTTPYGPAGTTPYVPEVTTLYVQAVTTTDVSEVTT HYIPGVTTPRVQVTTPNVPVTTSETRQTTAYSIPGTSTPIPLEQTTVKRSTTQSPLSPTSPSSYFQTSPT FPPTKSVTDLKELHPPTVVATYVPPYVTTPNILKPTTPSIPYITTPYVPEVTTPYLPAVTTPYVPKVTTP YVPVVTTPYVPEVTTQYVPVVTTPYVVEATTPYVPGVTTPYGPALTTPYVPGVTTPYVPAVTTPYAPAVT TPYVPGVTTPYVPAVTTPYVPAVTTPYVPAVTTPYVPAVTTPYVPAVTTPYVPGVTTPYVTAVTTPYVPE VTTPYAPAVTTPYVPGVTTPYVPAVTTPYVPEVTTPYVPAVTTPNVPEVTTPYVPAVTTPYVLEVTTPYV PAVTTPYIPELTTPNVPEVTTPDVPEATTQYMPEVTTPYVPEVTTPYAPAVTTPYVPGVTTPYVPALTTP YVPGVTTPYVPALTTPHVPEVTTLYVPAVTTPYVPEVTTPYVPEVTSQYFPWITTPRVQVTTSNMPVTTS ETRETTEYTIPGTSTPIPFEQTTVKRSTTQSQLSPTSPSSYLQTSSTFPPTKSVTDLKELHPPTVVATYV PPYVTTPNNLKPTTPNIPYITTPYVPEVTTPYVPAVTTPYVPEVITPYVPADTTPYVPEVTTPYVSAVTT PYVPEATTPYAPAVTTPYVPEVSTPYVPAVTTPYVPEVTTPYVPAVTTPYKKEVTTPYVPVVTTPNVPEV TTQYVPAVTTPYVPVVTTPYVPAMSTPYVPEVTTPYVPAMTTPNVPEATTPYVPSVTTPYVPEVTTPYAP AVTTPYVPEVTTPYVQAVTTPYVPEVTTPYAPAVTTPYVPKVTTPYVPAVTTPHVPEVTTPYVPAVTTPY LAEVTTHYVPEVTTPHIPAVTTPYVPEVTTPYTPQLTTPVLSTCYSGQFTCKEGSCVSGQSVCDQECDCS DCSDEHVCGSTVTPNTSSFSLTETTTSYMTTTEQQPASTTPEEKITSSTPSGCTLNPWTEWTPCSLTCGI GQRSRDRSYIQSVHGGVECNNTETHQDEYCNTDPCPTDGNWTPWSSWSDCDVTCNGGTSYRYRNCSNPPP KNGGKECEGVALETKVCNPQTCNTSCEAGRVYDPVCATRCPLTCADLQVGSLCIEESCESGCRCPDDMLE QDGQCIAQSDCDCWDESGNRHAPGSVTTEDCRNCTCVNGRYTCDEILCAIDCGWSSWSTWTTCSKTCGTG SQLRFRSPNNPPASNGGLECYGSGEEEQTCNTDECPTGCVYGNNTYADGEKVMQDLCNTCTCMNNSIHCT DNVCDGGWSSWSPWSACNATCDGGITVRSRSCSMPPPSNGGVGCVGDGMEVEECNTDSCPVDGGWCSWTS WSQCTKDCDMGYKERSRICDCPSSAYGGQKCPGIGSEQSECDGEPCPVDCHTNEWSDWSSCSATCDGGTS HRYRNVTIPAQYGGKKCQGPFVETMQCGVKPCTVCDEGLVEDECANRCPSTCADLQNGAECVAVNCTTGC HCPENMVLQDGQCVYQPECRCVLDPIILGLAIDMIVIPDDTGAIQMNDGSIQYMPGATIYQQCNNCTCSS GSFVCTELDCKVDCGWSAWSDWSECSGTCGRGESGKYRQRFTNNPEAAYGGLQCEGEDTEYASCDLQDCP CGDNEVWSYQATNCSSTCYDLYSTHIGTSEPVTCTNDPQESCTCLPGYYRDGSGQCVLPAECECLDENGV MRNHDDVWMKDGCTVCACLNGEAVCKSNCQPINCPAGFAPIFEDGQCCPICRKVSEPDTCSLIYEIKTVT NTLGCVAHNVNVTSCDGHCRSRSHIILLEPYMQQDCSCCHGDVESVELVTLTCPDGSKTQAPIAKISHCR CREALCSIQAESTVASL
???blast.query.upload???
???blast.options???
???blast.eval???
???blast.eval.01???
???blast.eval.10???
???blast.eval.1???
???blast.eval.001???
???blast.eval.minus5???
???blast.eval.minus25???
???blast.eval.minus50???
???blast.eval.minus100???
???blast.numalign???
???blast.numalign.25???
???blast.numalign.1???
???blast.numalign.5???
???blast.numalign.50???
???blast.numalign.100???
???blast.wordsize???
???blast.wordsize.default???
???blast.wordsize.2???
???blast.wordsize.3???
???blast.wordsize.4???
???blast.wordsize.5???
???blast.wordsize.6???
???blast.wordsize.7???
???blast.wordsize.8???
???blast.wordsize.9???
???blast.wordsize.10???
???blast.wordsize.11???
???blast.wordsize.12???
???blast.wordsize.13???
???blast.wordsize.14???
???blast.wordsize.15???
???blast.wordsize.default.message???
???blast.matrix???
???blast.matrix.blosum62???
???blast.matrix.blosum45???
???blast.matrix.blosum80???
???blast.matrix.pam30???
???blast.matrix.pam70???
???blast.gapedalgin???
???blast.true???
???blast.false???
Automatically set to False for sequences longer than 4500 bytes
???blast.filtering???
???blast.on???
???blast.off???
BLAST time is limited to 30 seconds