Click here to close
Hello! We notice that you are using Internet Explorer, which is not supported by Echinobase and may cause the site to display incorrectly. We suggest using a current version of
Chrome
,
FireFox
, or
Safari
.
Echinobase
???banner.login???
???banner.register???
Contact Us
Cite Echinobase
Genes
People
Labs
Organizations
Paper Authors
Paper Titles
Echinobase Accession
Anatomy Items
Disease Ontology
OMIM Diseases
GO Terms
Genes
People
Labs
Organizations
Paper Authors
Paper Titles
Echinobase Accession
Anatomy Items
Disease Ontology
OMIM Diseases
GO Terms
BLAST
Echinoderm mRNA
Echinoderm protein
Echinoderm CDS
S. purpuratus
(Purple sea urchin) 5.0
L. variegatus
(Green sea urchin) 3.0
P. miniata
(Bat star) 3.0
A. planci
(Crown-of-thorns) 1.0
L. pictus
(Painted urchin) 3.0
A. rubens
(Sugar star) 1.3
A. japonica
(Feather star) 1.0
Genomes
Download Echinoderm Genomes
S. purpuratus
(Purple sea urchin) 5.0
L. variegatus
(Green sea urchin) 3.0
P. miniata
(Bat star) 3.0
A. planci
(Crown-of-thorns) 1.0
L. pictus
(Painted urchin) 3.0
A. rubens
(Sugar star) 1.3
A. japonica
(Feather star) 1.0
JBrowse2 Tracks
Genes
Gene Search
Gene Search Tips
Gene Nomenclature Guidelines
Gene Name Questions
Expression
Search Anatomy Items
Quantitative Expression Datasets and Plotting Tools
Anatomy & Development
Search Diseases
Echinobase Anatomical Ontology (ECAO)
L. variegatus
Atlas of Development (pdf)
Resources
Protocols, Reagents and Data on EchinoWiki
Resource for Developmental Regulatory Genomics
Davidson Lab Gene Regulatory Networks
Libraries, Vectors and Screening
BAC Table
???header.navigation.echinobaseSearchAntibodies???
???header.navigation.searchMorpholinos???
Guide RNAs (gRNA)
Cis-Regulatory Elements (CREs)
Literature
Papers
Books
Cite Echinobase
Community
Find People
Find a Lab
Organizations
Job Postings
Downloads
Data Download
Gene Page Reports
Browse Download Site
BLAST Databases
???blast.header???
Download BLAST databases
???blast.alignment???
???blast.program.blastn???
???blast.program.blastp???
???blast.program.blastx???
???blast.program.tblastx???
???blast.program.tblastn???
???blast.database???
-- Genomes --
Strongylocentrotus purpuratus 5.0 Genome
Strongylocentrotus purpuratus 3.1 Genome
Lytechinus variegatus 3.0 Genome
Patiria miniata 3.0 Genome
Acanthaster planci 1.0 Genome
Lytechinus pictus 3.0 Genome
Lytechinus pictus 2.1 Genome
Asterias rubens 1.3 Genome
Anneissia japonica 1.0 Genome
-- mRNA --
Echinoderm mRNA
-- CDS --
Echinoderm CDS
-- Protein --
Echinoderm Protein
???blast.query???
>XM_038221998.1 PREDICTED: Patiria miniata fibrillin-2-like (LOC119745555), transcript variant X47, mRNA CTCGCTGGTATCCGGCAAATTCACCGTAAATAACCGAGGTCGTTTATTGTGCAGTCTACCTTGCCTTTGA ACAGCGTTCGCGGCGGTAGGGCAAACTTGGCTTTCCCCATTTTCCTCACAACTTCTGAAGTTTCTGGCCC CAGTTGCTTTCTAAAAAAACTCACTCAGTCAGGCCTGCTTCGTCTTTCGTTCAACGCTTGACGAAAGATT TTCAGGATGCGACACGCTGTGCTTGTGGGATTCCTGCTGGCGTTGGCTCACGCCGCGTACAGTGACGAGG TTGGAGTCGTCTGTCCAGGCGGTCAGTCTCAATGTCCTGACGGTAACACCTGCTGCCAGCTAGCCTCTGG ACAATGGGGATGCTGCCCTCTACCTAAGGCGGTTTGCTGTAGTGACCATCTACACTGTTGCCCGAATGGC TACACTTGCGACGTCGGTGCTGGAAGTTGTTCAAAGGGAGGGCTGACTGTCCCATGGGCAGAGAAGAACA TGGCTAAGCCAGTTAAGGTTGAAAGCGTTGTCTGTCCAGGCAGTCAAGCCGAATGTCCAGATGGTAACAC CTGCTGCAAGCTGAGCTCTGGACAATGGGGCTGCTGCCCACTACCAAATGCCGTGTGCTGTAGTGACCAT GTACATTGTTGCCCGAACGGCTACACTTGCAGTTCTGGAAGTTGTTCAAAGGGAGATCTTACTGTCCCAT GGACAGAGAAGAACGTCGCTAAGCCAGTTAAGGTTGAAAGCGTCGTCTGCCCAGACGGTCAGTCCGAATG TCCAGATGGTAACACCTGCTGCAAGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGCTGCCCACTACCAAATGCGGTT TGCTGTAGCGACCATCAACACTGTTGCCCGAATGGCTACAAGTGCGACGTCAGCACTGGAAGTTGTTCAA AGGGAGGGCTGACTGTCCCATGGGCAGAGAAGAACGTCGCTAAGCCAGTTAAGGTTGAAAGCGTCGTCTG TCCAGATGGTCAGTCCGAATGTCCAGATGGCAACACCTGCTGCAAGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGC TGCCCACTACCAAATGCCGTGTGCTGTAGTGACCATGTACATTGTTGCCCGAGCGGCTACACTTGCAGTT CTGGAAGTTGTTCACGGGGAGATCTTACTGTCCCATGGACAGAGAAGAACGTCGCTAAGCCAGTTAAGGT TGAAAACGTCGTCTGTCCAGGCGGTCAGTCCGAATGTCCAGATGGTAACACCTGCTGTAAGCTGAGCTCT GGACAATACGGCTGCTGCCCACTACCAAATGCGGTTTGCTGTAGCGACCATCAACACTGTTGCCCGAATG GCTACAAGTGCGACGTCAGCGCTGGAAGTTGTTCACAGGGAGGGCTGACTGTCCCATGGGCAGAGAAGAA CGTCGCTAAGCCAGTCGAGGATCCAGAAAAGACGAACGTAACGGTATGTCCAGGGGGTCGGTACTTGTGT AAGGTGAACTACACCTGCTGTATGTCCAAAACGCCCGACGTTTACGGTTGCTGCCATTTTAAAGAGGCTA CGTGTTGCAGCGACAATGTACACTGCTGCCAACATGGATATGTATGTGACGTAGTTAAGCACAAGTGCAA GAAGAACTTTGAATCCATTCCTTGGGAGGAAAAAACTGATGCAGAGGAGTTGACGACAGAGATTGTACCA GAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCT CTGGACAATGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGCGATCATGTCCATTGCTGTCCTCA CGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACATGTTCACTTGGAAACATGGTTCTGGCATGGTATGAGAAG ACTGAAGCCAAACCTCTAGTACCAGAGTCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTG GTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAA TGACCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAGAC ATGGTTCTTACATGGTATGAGAAGACAGAAGCCAAACCTCTGGTACAAGAACCAAACGTTGTATGCCCTG GTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGTCCTCTGGACAATGGGGCTGCTGTCC ACTCCCTCAGGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCATGGATACACCTGTGATGTCTCT CAAGGAACATGTTCACTTGGAAATTCAGTTCTGCAAATGTATAAGAAGACAGAAGCCACATCCCTAAGCA CTGCTGTTCTTCCAGGACCTGACGTCGTATGTCCAGGTGGTTCAGCTCAATGCCCAACTGGAAACACCTG CTGCATGCTTTCATCTGGACAGTGGGGCTGCTGCCCACTTCCTCAGGCTGTGTGCTGCAGTGACCACGTC CACTGTTGTCCCCATGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGAAACCTGTTCACTTGGAGACATGGTTCTAA CATGGTATGAGAAGACTGAAGCCAAACCTCTAGTACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGC CCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTTGCCTCCGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGT GCTGTGTGCTGTAGTGACCATGTCCACTGCTGTCCCAATGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCT GTTCACTTGGCAAGATGGTTCTACCATGGTTCGACAAGACAGAGGCCACCTCCCTTAGTACTAATAATTC ACCATCCCCGAACATCATATGTCCTGGAGGCAGATATCAATGTCCAACAGGAACTACGTGTTGCAAGTCG AACACCGGTGCTTATAACTGCTGCCCATATCCACAGGCTGTTTGCTGTGCTGACTACATACACTGCTGTC CATATGGCTATATTTGTGAGCTTTCAACGGCAACGTGCCACCTAAATGGCCTTTCTCTACCGTGGGAATC AAACAAAGAAGCTGTATCGCTGAGTGATCCAGCGATGCCAGAACCAAACGTTGTATGCCCTGGTGGTTCA GCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGCTGTCCACTCCCTA GTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAAC CTGTTCACTTGGAGACATGGTTCTGGCATGGTATGAGAAGTCAGAAGCCAAACCTGTTGTACCAGAGCCG AATGTGGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCGTCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCTTCTGGAC AGTGGGGGTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGCGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATA CACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACATGTTCTCTTGGAGATATGGTTCTCACATGGTATGAGAAGACAGAA GCCAAACCTCTAGTACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACA CCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCA TGTCCAATGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACATGTTCACTTGGAAACATGGTT CTGGCATGGTATGAGAAGTCAGAGGCCAAACCTCTAGTACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCCAGGTGGTT CAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTACC TAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGA ACATGTTCTCTTGGAGATATGGTACAGTCATGGTATGAGAAGACTGAAGCCAAACCTGTTGTACCAGAGC CGAATGTCGTTTGCCCTGGTGGTTCAGCACAGTGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGG ACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGA TACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACGTGTTCTCTTGGAGATATGGTACAGTCATGGTATGAGAAGACAG AAGCCAAACCTCTAGTACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAA CACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGCTGTCCACTACCTAGTGCTGTGTGCTGCAGCGAT CATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATATACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACATGTTCACTTGGAAACATGG TTCTGGCATGGTATGAGAAGTCAGAAGCCAAACCTGTTGTACCAGAGCCGAATGTGGTATGCCCTGGTGG TTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGCTGTCCACTC CCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGACCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGG GAACCTGTTCACTTGGAAATATGGTTCTAACGTGGTATGAGAAGTCAGAAGCCAAACCTGTTGTACCAGA GCCGAATGTGGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCT GGACAATGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACG GATACACCTGTGATGTCTCTCAAGGAACCTGTTCACTTGGAGATATGGTTCTAACGTGGTATAAGAAGAC AGAAGCCAAACCTCTAGTACCAGAGCCGAATGTTGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGT AACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTG ATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAGATAT GGTACAGTCATGGTATGAGAAGACAGAAGCCAAACCTCTAGTACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGT GGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTTGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCAC TCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCA GGGAACCTGTTCACTTGGAGATATGGTACAGTCATGGTATGAGAAGACAGAAGCCAAACCTCTAGTACCA GAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTTGCCT CTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCA CGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAGATATGGTACAATCATGGTATGAGAAG ACTGAAGCCAAACCTCTAGTACCAGAGCCGAATGTTGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTG GTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGCTGTCCACTACCTAGTGCTGTGTGCTGCAG TGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACATGTTCTCTTGGAGAT ATGGTACAGTCATGGTATGAGAAGACTGAAGCCAAACCTTTAGTACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCCTG GTGGTTCAGCCCAATGCCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCC ACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGCGATCATGTCCATTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCT CAGGGAACATGTTCACTTGGAAACATGGTTCTGGCATGGTATGAGAAGTCAGAAGCCAAACCTGTAGTAC CAGAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGC CTCTGGACAATGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGACCATGTCCACTGCTGTCCT CACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAGATATGGTTCTTACGTGGTATGAGA AGACAGAAGCCAAACCTCTAGTACCAGAGCCGAATGTTGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATC TGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGC AGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAG ATATGGTACAGTCATGGTATGAGAAGACTGAAGCCAAACCTCTAGTACCCGAGCCGAATGTCGTATGCCC TGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGT CCACTCCCTAGTGCCGTATGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCT CTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAGATATGGTACAGTCATGGTTTGAGAAGACAAAGGCGAGCCCTCTGGT TCCAGAGCCGAATGTTGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGCCCATCTGGTCACACCTGCTGCATGCTG GCCTTTGGACAATGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTC CTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAGATATGGTACAGTCATGGTATGA GAAGACTGAAGCCAAACCTCTAGTACCAGAGCCGAATGTTGTATGCCCTGGTGGTTCAGCTCAGTGTCCA TCTGGTAACACCTGCTGCATGCTTGCCTCCGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCCGTATGCT GCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACATGTTCACTTGG AGATATGGTACAGTCATGGTTTGAGAAGACAAAGGCGAGCCCTCTGGTTCCAGAGCCGAATGTTGTATGC CCTGGTGGTTCAGCCCAATGCCCATCTGGAAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGCT GTCCACTCCCTACTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGT CTCTCAGGGAACATGTTCACTTGGAGATATGGTACAGTCATGGTATGAGAAGACTGAAGCCAAACCTTTA GTACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGC TTGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTG TCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAAGGAACCTGTTCACTTGGAGACATGGTTCTAACGTGGTAT GAGAAGACAGAGGCCAAACCTCTAGTACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTC CATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCCGGACAGTGGGGCTGCTGCCCACTGCCTCAGGCTGTGTG TTGCAGTGACCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTT GGAAATTCAGTTCTACCGTGGTTTGAGAAGACGGACACCCTTCTTAACTTTGAAGGTATTGTGTGTCCCA ACAGCACATCCATCTGCAAGAGCTCCGAGACTTGCTGCAAGCTGAAAAGTGGCAGCTGGGGGTGCTGCCC TCTAGTGCAAGCTGTCTGCTGTTCAGACAAACTTCACTGCTGTCCTAAAAACACCAAATGCACAGCTAAG AACACTTGTGTCGGTACCTTTGGGTCCACGCCAATGGTAACCAAGACCCAAGCCAAAGAAATCGCACCCA AGCCGAAGCACGTGCCTTGGATGACCAAGACTCTGGCCCTACCGTGGGGGAGCAAAGAGGGTGACGTGCA GTGTGATGCCACCCATTATTGCCCCAGCGGTAACACCTGCTGCCGGCTGGCCAGCGGACAATGGGGATGC TGCCCAGTACCCAAGGCTGTGTGTTGTTCAGATGGCTTGCACTGTTGCCCCAGTGGATACACTTGCCAAA CTGGCACTGGCCGATGCGTGCGATAAATCGCAAGACCGCAAGCTACGGCACGTCGAAAATTAAACCAGGA GAACATATAAACTGAGCTTGTAGTTTAATACTGTCATATAATCGGAATTATGTGTTGTTTAATTTTTGAT TTTGTTTTTCTGTTTTGACAATCAAATAAAATATACACGCTTGATGTAATTGCGGAAAATATAGAGAGAA AAAAAAGGATTTTTCCAACAAAACATACTTTACTTTTAGTGCACCTTGACTTCTTTTGAGTTGATTGAAA TAAGCGTTGGCCCAGTCCCAGGTGATGTATTCAAAACAAACATTAGGTGTCTGAAAGAGTCAGAAATATA GAGACCCTTTGTTTCACCAATTATATCCATGACCCCTCCTGCTATCTAAACAGTCACAGACAGTCAAAAA AAATCAAGTATGTTCCCCTGCCATGCCTTTTACACGGGCTAGTCACCAACGGTCCGATCATATTTCCAGC AAGCACTGTGACTAGTCAAATTCAGTCAACAGACAAAAAGCAGGCAAGAAGTAGGCACAGCTGGCTTATC AATCACCTACAGTCAAAGCATAGCTATATCAAGTTACACAAACAGTCACAGCCAGCCAATCCTGTTTTAT CTGGGAAGTTCAAAACAGTCACTTGATTGCGTTTGACTGCAAGGACAACTTTGCACAGAATGTAGGTTTG AAGAGGAGGGTCGTCTGATATGCATCCACAGAAGTCCAACATGCATTCACGCTAGCATAACACACCCAGC TTGATCGTGAAGTGCAGCCTTGGACAGGCACAGTATGTGAAACCTAACGGATCGGTCAATTGTTGGGCTT CTTCAACTCAGTAGTTTCTTAAGAGTTTCTGAACTTAAAAATAGCTTGCACAGTAACACAGTGGTTAA
???blast.query.upload???
???blast.options???
???blast.eval???
???blast.eval.01???
???blast.eval.10???
???blast.eval.1???
???blast.eval.001???
???blast.eval.minus5???
???blast.eval.minus25???
???blast.eval.minus50???
???blast.eval.minus100???
???blast.numalign???
???blast.numalign.25???
???blast.numalign.1???
???blast.numalign.5???
???blast.numalign.50???
???blast.numalign.100???
???blast.wordsize???
???blast.wordsize.default???
???blast.wordsize.2???
???blast.wordsize.3???
???blast.wordsize.4???
???blast.wordsize.5???
???blast.wordsize.6???
???blast.wordsize.7???
???blast.wordsize.8???
???blast.wordsize.9???
???blast.wordsize.10???
???blast.wordsize.11???
???blast.wordsize.12???
???blast.wordsize.13???
???blast.wordsize.14???
???blast.wordsize.15???
???blast.wordsize.default.message???
???blast.matrix???
???blast.matrix.blosum62???
???blast.matrix.blosum45???
???blast.matrix.blosum80???
???blast.matrix.pam30???
???blast.matrix.pam70???
???blast.gapedalgin???
???blast.true???
???blast.false???
Automatically set to False for sequences longer than 4500 bytes
???blast.filtering???
???blast.on???
???blast.off???
BLAST time is limited to 30 seconds