Click here to close
Hello! We notice that you are using Internet Explorer, which is not supported by Echinobase and may cause the site to display incorrectly. We suggest using a current version of
Chrome
,
FireFox
, or
Safari
.
Echinobase
???banner.login???
???banner.register???
Contact Us
Cite Echinobase
Genes
People
Labs
Organizations
Paper Authors
Paper Titles
Echinobase Accession
Anatomy Items
Disease Ontology
OMIM Diseases
GO Terms
Genes
People
Labs
Organizations
Paper Authors
Paper Titles
Echinobase Accession
Anatomy Items
Disease Ontology
OMIM Diseases
GO Terms
BLAST
Echinoderm mRNA
Echinoderm protein
Echinoderm CDS
S. purpuratus
(Purple sea urchin) 5.0
L. variegatus
(Green sea urchin) 3.0
P. miniata
(Bat star) 3.0
A. planci
(Crown-of-thorns) 1.0
L. pictus
(Painted urchin) 3.0
A. rubens
(Sugar star) 1.3
A. japonica
(Feather star) 1.0
Genomes
Download Echinoderm Genomes
S. purpuratus
(Purple sea urchin) 5.0
L. variegatus
(Green sea urchin) 3.0
P. miniata
(Bat star) 3.0
A. planci
(Crown-of-thorns) 1.0
L. pictus
(Painted urchin) 3.0
A. rubens
(Sugar star) 1.3
A. japonica
(Feather star) 1.0
JBrowse2 Tracks
Genes
Gene Search
Gene Search Tips
Gene Nomenclature Guidelines
Gene Name Questions
Expression
Search Anatomy Items
Quantitative Expression Datasets and Plotting Tools
Anatomy & Development
Search Diseases
Echinoderm Anatomy and Development Ontology (ECAO)
L. variegatus
Atlas of Development (pdf)
Resources
Protocols, Reagents and Data on EchinoWiki
Resource for Developmental Regulatory Genomics
Davidson Lab Gene Regulatory Networks
Libraries, Vectors and Screening
BAC Table
???header.navigation.echinobaseSearchAntibodies???
???header.navigation.searchMorpholinos???
Guide RNAs (gRNA)
Cis-Regulatory Elements (CREs)
Literature
Papers
Books
Cite Echinobase
Community
Find People
Find a Lab
Organizations
Job Postings
Downloads
Data Download
Gene Page Reports
Browse Download Site
BLAST Databases
???blast.header???
Download BLAST databases
???blast.alignment???
???blast.program.blastn???
???blast.program.blastp???
???blast.program.blastx???
???blast.program.tblastx???
???blast.program.tblastn???
???blast.database???
-- Genomes --
Strongylocentrotus purpuratus 5.0 Genome
Strongylocentrotus purpuratus 3.1 Genome
Lytechinus variegatus 3.0 Genome
Patiria miniata 3.0 Genome
Acanthaster planci 1.0 Genome
Lytechinus pictus 3.0 Genome
Lytechinus pictus 2.1 Genome
Asterias rubens 1.3 Genome
Anneissia japonica 1.0 Genome
-- mRNA --
Echinoderm mRNA
-- CDS --
Echinoderm CDS
-- Protein --
Echinoderm Protein
???blast.query???
>XM_038222001.1 PREDICTED: Patiria miniata fibrillin-2-like (LOC119745555), transcript variant X50, mRNA CGCTGGTATCCGGCAAATTCACCGTAAATAACCGAGGTCGTTTATTGTGCAGTCTACCTTGCCTTTGAAC AGCGTTCGCGGCGGTAGGGCAAACTTGGCTTTCCCCATTTTCCTCACAACTTCTGAAGTTTCTGGCCCCA GTTGCTTTCTAAAAAAACTCACTCAGTCAGGCCTGCTTCGTCTTTCGTTCAACGCTTGACGAAAGATTTT CAGGATGCGACACGCTGTGCTTGTGGGATTCCTGCTGGCGTTGGCTCACGCCGCGTACAGTGACGAGGTT GGAGTCGTCTGTCCAGGCGGTCAGTCTCAATGTCCTGACGGTAACACCTGCTGCCAGCTAGCCTCTGGAC AATGGGGATGCTGCCCTCTACCTAAGGCGGTTTGCTGTAGTGACCATCTACACTGTTGCCCGAATGGCTA CACTTGCGACGTCGGTGCTGGAAGTTGTTCAAAGGGAGGGCTGACTGTCCCATGGGCAGAGAAGAACATG GCTAAGCCAGTTAAGGTTGAAAGCGTTGTCTGTCCAGGCAGTCAAGCCGAATGTCCAGATGGTAACACCT GCTGCAAGCTGAGCTCTGGACAATGGGGCTGCTGCCCACTACCAAATGCCGTGTGCTGTAGTGACCATGT ACATTGTTGCCCGAACGGCTACACTTGCAGTTCTGGAAGTTGTTCAAAGGGAGATCTTACTGTCCCATGG ACAGAGAAGAACGTCGCTAAGCCAGTTAAGGTTGAAAGCGTCGTCTGCCCAGACGGTCAGTCCGAATGTC CAGATGGTAACACCTGCTGCAAGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGCTGCCCACTACCAAATGCGGTTTG CTGTAGCGACCATCAACACTGTTGCCCGAATGGCTACAAGTGCGACGTCAGCACTGGAAGTTGTTCAAAG GGAGGGCTGACTGTCCCATGGGCAGAGAAGAACGTCGCTAAGCCAGTTAAGGTTGAAAGCGTCGTCTGTC CAGATGGTCAGTCCGAATGTCCAGATGGCAACACCTGCTGCAAGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGCTG CCCACTACCAAATGCCGTGTGCTGTAGTGACCATGTACATTGTTGCCCGAGCGGCTACACTTGCAGTTCT GGAAGTTGTTCACGGGGAGATCTTACTGTCCCATGGACAGAGAAGAACGTCGCTAAGCCAGTTAAGGTTG AAAACGTCGTCTGTCCAGGCGGTCAGTCCGAATGTCCAGATGGTAACACCTGCTGTAAGCTGAGCTCTGG ACAATACGGCTGCTGCCCACTACCAAATGCGGTTTGCTGTAGCGACCATCAACACTGTTGCCCGAATGGC TACAAGTGCGACGTCAGCGCTGGAAGTTGTTCACAGGGAGGGCTGACTGTCCCATGGGCAGAGAAGAACG TCGCTAAGCCAGTCGAGGATCCAGAAAAGACGAACGTAACGGTATGTCCAGGGGGTCGGTACTTGTGTAA GGTGAACTACACCTGCTGTATGTCCAAAACGCCCGACGTTTACGGTTGCTGCCATTTTAAAGAGGCTACG TGTTGCAGCGACAATGTACACTGCTGCCAACATGGATATGTATGTGACGTAGTTAAGCACAAGTGCAAGA AGAACTTTGAATCCATTCCTTGGGAGGAAAAAACTGATGCAGAGGAGTTGACGACAGAGATTGTACCAGA GCCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCT GGACAATGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAATGACCATGTCCACTGCTGTCCTCACG GATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAGATATGGTTCTTACATGGTATGAGAAGAC AGAAGCCAAACCTCTGGTACCAGAACCAAACGTTGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGT AACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGCTGTCCACTCCCTCAGGCTGTGTGCTGCAGTG ACCATGTCCACTGCTGTCCTCATGGATACACCTGTGATGTCTCTCAAGGAACATGTTCACTTGGAAATTC AGTTCTGCAAATGTATAAGAAGACAGAAGCCACATCCCTAAGCACTGCTGTTCTTCCAGGACCTGACGTC GTATGTCCAGGTGGTTCAGCTCAATGCCCAACTGGAAACACCTGCTGCATGCTTTCATCTGGACAGTGGG GCTGCTGCCCACTCCCTCAGGCTGTGTGCTGCAGTGACCACGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTG TGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAGACATGGTTCTTACATGGTATGAGAAGTCAGAAGCCAAA CCTCTAGTACCAGAGCCGAATGTTGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCT GCATGCTGGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGCCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGTAGTGACCATGTCCA CTGCTGTCCCAATGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGCAAGATGGTTCTACCA TGGTTCGACAAGACAGAGGCCACATCCCTTAGTACTAATAATTCACCATCCCCGAACATCATATGTCCTG GAGGCAGATATCAGTGTCCCACAGGAACTACATGTTGCAAGTCGAACACTGGTGCTTATAACTGCTGCCC ATATCCACAGGCTGTTTGCTGTGCTGACTACATACACTGCTGTCCATATGGCTATATTTGTGAGCTTTCA ACAGCAACGTGCCACCTAAATGGCCTTTCTCTACCGTGGGAATCGAACAAAGAAGCTGTATCGCTGAGTG ATCCAGCGATGCCAGAACCAAACGTTGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTG CTGCATGCTGGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGCGATCATGTC CATTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACATGTTCACTTGGAAACATGGTTCTGG CATGGTATGAGAAGACTGAAGCCAAACCTCTAGTACCAGAGTCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGC CCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGT GCTGTGTGCTGCAGCGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACAT GTTCTCTTGGAGATATGGTTCTCACATGGTATGAGAAGACAGAAGCCAAACCTCTAGTACCAGAGCCGAA TGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAG TGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCAATGCTGTCCTCACGGATACA CCTGTGATGTCTCTCAGGGAACATGTTCACTTGGAAACATGGTTCTGGCATGGTATGAGAAGTCAGAGGC CAAACCTCTAGTACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCCAGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACC TGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTACCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATG TCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACATGTTCTCTTGGAGATATGGTACA GTCATGGTATGAGAAGACTGAAGCCAAACCTGTTGTACCAGAGCCGAATGTCGTTTGCCCTGGTGGTTCA GCACAGTGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTA GTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAAC GTGTTCTCTTGGAGATATGGTACAGTCATGGTATGAGAAGACAGAAGCCAAACCTCTAGTACCAGAGCCG AATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGAC AATGGGGCTGCTGTCCACTACCTAGTGCTGTGTGCTGCAGCGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATA TACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACATGTTCACTTGGAAACATGGTTCTGGCATGGTATGAGAAGTCAGAA GCCAAACCTGTTGTACCAGAGCCGAATGTGGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACA CCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGACCA TGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAAATATGGTT CTAACGTGGTATGAGAAGTCAGAAGCCAAACCTGTTGTACCAGAGCCGAATGTGGTATGCCCTGGTGGTT CAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGCTGTCCACTCCC TAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAAGGA ACCTGTTCACTTGGAGATATGGTTCTAACGTGGTATAAGAAGACAGAAGCCAAACCTCTAGTACCAGAGC CGAATGTTGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGG ACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGA TACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAGATATGGTACAGTCATGGTATGAGAAGACAG AAGCCAAACCTCTAGTACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAA CACCTGCTGCATGCTTGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGAT CATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAGATATGG TACAGTCATGGTATGAGAAGACAGAAGCCAAACCTCTAGTACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGTGG TTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTTGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTC CCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGG GAACCTGTTCACTTGGAGATATGGTACAATCATGGTATGAGAAGACTGAAGCCAAACCTCTAGTACCAGA GCCGAATGTTGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCT GGACAATGGGGCTGCTGTCCACTACCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACG GATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACATGTTCTCTTGGAGATATGGTACAGTCATGGTATGAGAAGAC TGAAGCCAAACCTTTAGTACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGCCCATCTGGT AACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGCG ATCATGTCCATTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACATGTTCACTTGGAAACAT GGTTCTGGCATGGTATGAGAAGTCAGAAGCCAAACCTGTAGTACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGT GGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGCTGTCCAC TCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGACCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCA GGGAACCTGTTCACTTGGAGATATGGTTCTTACGTGGTATGAGAAGACAGAAGCCAAACCTCTAGTACCA GAGCCGAATGTTGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTGGCCT CTGGACAATGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCA CGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAGATATGGTACAGTCATGGTATGAGAAG ACTGAAGCCAAACCTCTAGTACCCGAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTG GTAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCCGTATGCTGCAG TGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAGAT ATGGTACAGTCATGGTTTGAGAAGACAAAGGCGAGCCCTCTGGTTCCAGAGCCGAATGTTGTATGCCCTG GTGGTTCAGCCCAATGCCCATCTGGTCACACCTGCTGCATGCTGGCCTTTGGACAATGGGGCTGCTGTCC ACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCT CAGGGAACCTGTTCACTTGGAGATATGGTACAGTCATGGTATGAGAAGACTGAAGCCAAACCTCTAGTAC CAGAGCCGAATGTTGTATGCCCTGGTGGTTCAGCTCAGTGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTTGC CTCCGGACAGTGGGGCTGCTGTCCACTCCCTAGTGCCGTATGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCT CACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACATGTTCACTTGGAGATATGGTACAGTCATGGTTTGAGA AGACAAAGGCGAGCCCTCTGGTTCCAGAGCCGAATGTTGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGCCCATC TGGAAACACCTGCTGCATGCTGGCCTCTGGACAATGGGGCTGCTGTCCACTCCCTACTGCTGTGTGCTGC AGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACATGTTCACTTGGAG ATATGGTACAGTCATGGTATGAGAAGACTGAAGCCAAACCTTTAGTACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCC TGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTTGCCTCTGGACAGTGGGGCTGCTGT CCACTCCCTAGTGCTGTGTGCTGCAGTGATCATGTCCACTGCTGTCCTCACGGATACACCTGTGATGTCT CTCAAGGAACCTGTTCACTTGGAGACATGGTTCTAACGTGGTATGAGAAGACAGAGGCCAAACCTCTAGT ACCAGAGCCGAATGTCGTATGCCCTGGTGGTTCAGCCCAATGTCCATCTGGTAACACCTGCTGCATGCTG GCCTCCGGACAGTGGGGCTGCTGCCCACTGCCTCAGGCTGTGTGTTGCAGTGACCATGTCCACTGCTGTC CTCACGGATACACCTGTGATGTCTCTCAGGGAACCTGTTCACTTGGAAATTCAGTTCTACCGTGGTTTGA GAAGACGGACACCCTTCTTAACTTTGAAGGTATTGTGTGTCCCAACAGCACATCCATCTGCAAGAGCTCC GAGACTTGCTGCAAGCTGAAAAGTGGCAGCTGGGGGTGCTGCCCTCTAGTGCAAGCTGTCTGCTGTTCAG ACAAACTTCACTGCTGTCCTAAAAACACCAAATGCACAGCTAAGAACACTTGTGTCGGTACCTTTGGGTC CACGCCAATGGTAACCAAGACCCAAGCCAAAGAAATCGCACCCAAGCCGAAGCACGTGCCTTGGATGACC AAGACTCTGGCCCTACCGTGGGGGAGCAAAGAGGGTGACGTGCAGTGTGATGCCACCCATTATTGCCCCA GCGGTAACACCTGCTGCCGGCTGGCCAGCGGACAATGGGGATGCTGCCCAGTACCCAAGGCTGTGTGTTG TTCAGATGGCTTGCACTGTTGCCCCAGTGGATACACTTGCCAAACTGGCACTGGCCGATGCGTGCGATAA ATCGCAAGACCGCAAGCTACGGCACGTCGAAAATTAAACCAGGAGAACATATAAACTGAGCTTGTAGTTT AATACTGTCATATAATCGGAATTATGTGTTGTTTAATTTTTGATTTTGTTTTTCTGTTTTGACAATCAAA TAAAATATACACGCTTGATGTAATTGCGGAAAATATAGAGAGAAAAAAAAGGATTTTTCCAACAAAACAT ACTTTACTTTTAGTGCACCTTGACTTCTTTTGAGTTGATTGAAATAAGCGTTGGCCCAGTCCCAGGTGAT GTATTCAAAACAAACATTAGGTGTCTGAAAGAGTCAGAAATATAGAGACCCTTTGTTTCACCAATTATAT CCATGACCCCTCCTGCTATCTAAACAGTCACAGACAGTCAAAAAAAATCAAGTATGTTCCCCTGCCATGC CTTTTACACGGGCTAGTCACCAACGGTCCGATCATATTTCCAGCAAGCACTGTGACTAGTCAAATTCAGT CAACAGACAAAAAGCAGGCAAGAAGTAGGCACAGCTGGCTTATCAATCACCTACAGTCAAAGCATAGCTA TATCAAGTTACACAAACAGTCACAGCCAGCCAATCCTGTTTTATCTGGGAAGTTCAAAACAGTCACTTGA TTGCGTTTGACTGCAAGGACAACTTTGCACAGAATGTAGGTTTGAAGAGGAGGGTCGTCTGATATGCATC CACAGAAGTCCAACATGCATTCACGCTAGCATAACACACCCAGCTTGATCGTGAAGTGCAGCCTTGGACA GGCACAGTATGTGAAACCTAACGGATCGGTCAATTGTTGGGCTTCTTCAACTCAGTAGTTTCTTAAGAGT TTCTGAACTTAAAAATAGCTTGCACAGTAACACAGTGGTTAA
???blast.query.upload???
???blast.options???
???blast.eval???
???blast.eval.01???
???blast.eval.10???
???blast.eval.1???
???blast.eval.001???
???blast.eval.minus5???
???blast.eval.minus25???
???blast.eval.minus50???
???blast.eval.minus100???
???blast.numalign???
???blast.numalign.25???
???blast.numalign.1???
???blast.numalign.5???
???blast.numalign.50???
???blast.numalign.100???
???blast.wordsize???
???blast.wordsize.default???
???blast.wordsize.2???
???blast.wordsize.3???
???blast.wordsize.4???
???blast.wordsize.5???
???blast.wordsize.6???
???blast.wordsize.7???
???blast.wordsize.8???
???blast.wordsize.9???
???blast.wordsize.10???
???blast.wordsize.11???
???blast.wordsize.12???
???blast.wordsize.13???
???blast.wordsize.14???
???blast.wordsize.15???
???blast.wordsize.default.message???
???blast.matrix???
???blast.matrix.blosum62???
???blast.matrix.blosum45???
???blast.matrix.blosum80???
???blast.matrix.pam30???
???blast.matrix.pam70???
???blast.gapedalgin???
???blast.true???
???blast.false???
Automatically set to False for sequences longer than 4500 bytes
???blast.filtering???
???blast.on???
???blast.off???
BLAST time is limited to 30 seconds