LOC581955 Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (0)

Nucleotides (9)

Interactants (0)

ECB-GENEPAGE-23193324

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for LOC581955 - All

Models - Gene (3)

Models - mRNA (1)

mRNAs (5)

ESTs (0)

Models - Gene (3)

Source	Version	Model	Species
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variegatus
NCBI_REFSEQ/JGI	3.1	LOC581955 >LOC581955 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purpuratus

Models - mRNA (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	XM_781932.5 >XM_781932.5 AATCGACCAGTTCGCCTGCACTGAGTATACCGGTGCTAGCGACCGAACAATGAGGGTGTAAACAAACAGATGCAACCATACAAATCTTCAGCACACGGCACACTGCGTTCGATCGTCACTAAATCGCAAATCCATCTCCGAGAGCAACACGTACTCTGAAAATTTTTTGCCTCACATCTGACGGAAAAACACTGAAATATATTCAAAATGAAGGTCCTTAAATGCTGCTCCATCGCCCTGTCGGCAAAATTTATCATGTTCTGTCTCTCAGTCCTCTTTTGGATTGGTTCTGCTGGTCTCATGTACCTCGGTATTGAGATGTTCACATATGCCGGAAACATCCACCACCTTGCCAGCAACTATTTCTTGACCATCCCCGCCAGCGTGTGCATCGGTCTCAGTATTCTTTTCCTGACCGTCGGTATCATCGGACTCATCGCTCTTACCAGGGAAGATGCTAGGTTCCTCAGGAGAATGTTTGTTGCCTTGCTAATGGTTATCGTCATTCTGGAGATCACAGGGGCTGCCCTTGCTATTGCCTTCAAGGAGGAGATCAACACGGGTATTGACAATGGACTTAATAACACCATGAAACATTACAATGAGAAAGAGAACTACCAGAGGTCAATGGACTACGTACAAGGACATCTTGATTGCTGTGGATCCCACCACGCTGAGGACTGGGCCACCACTCCATGGGGTCACGCTAACCCCGACATGGTCCCTCTTAGCTGCTGTAAGGATAACGCTACAGCCAACTGCACGGGGTCACTGGTCAACGATCAGTTCAACATCAACCACGATGGTTGTCAAGAAAAGCTTTACGATGACATCAAGGCTTATCTTGTATACATCATCATTATTGCAGTTCTTCTCTTTCTTTTGCAGTCTATGGCCCTCTGTTGTACCTGCTACCTGGTGTGTCATCGACGGGACAAGCAATACCAACAGCTCCAGACACCCTCCAAGCGTGAGTCAAGCTACGGGTACAGGGCATAAATCATCTACAAAAAAAGACTATTACCAGACGCACAAATGTAATCAAGAATCATTGATATCCCCAAAAATCATCTACAGAAAAAGACTGTTACGCACAAATGTTTACCAGAATCAGTGATCTCCCAGGGTGTTTGACAACCTTGATATAGTGGACACCTCTACAGAAGGGCCACCTGTCTACAAAGGCCAGCATGTTCTGCATTCGCAATGATATATATTACAGCACAGCATGTTCCAGGGTATTCATTGGCATAACTGTCTGAAAAAATAGAAAGGTCTGGGGGGTTTTTGGAAAAGTTATCCGATCTATCCATTTGTGAATTAAAAATGGATTAACTTTTTCTTTTTTGAGTTCCAAGAATTTACTCAAGTCACACTTCTTGCTCATTATAACATTCCATTTTCTTATTTGTTGTTTTTCTTGAGCTCACATTATTATAAATTATCTTGACACCATAATTAGCTAACTGAGGATCAGCAAAAGACTATGATTATTTAGGTATATGATTGATCATGAATTTCATTAGTCAGAGTAAATAATGTTTCTTTGTAGGCTGAGTAAAGAAAATGTCTTTTTATGAGATAGCAAATAGTGTTATGAAAAACATGGAGTAATTGCCTTCACTTAAACATTATTTGTGTCACATGTTGTGCTTTATAGTCGGATGTTTTTCTAAAACAGGTGCAAGCTTATAGAAAGTAATGGTGATTTCGTGATAGAAATGAATTTTTAAGAAACGTGTAAAAGCAAGTGTCTTCTGTATGTCACTCAGGTTTTTTTTCGTCCAGAAGAAAAGTGTGTGTTTCTAAATACATGTTGACTTTCATATTGTGCGAAACCTTTTAATACCCTACATGTATTTTATCTTTGGGATGGTATTATAAATGTGTGTGCCTGTAGCATGTATTTATTTGAAAATGGTCATTCATTTTGAAGATTGTGGAGTGCCAGGATTGTCGAGTCTGACATGAGCACCATACAAGAATCCCTTATTATTATTATTGTTAATATTTCCAATACCCTGCCAAAGTGAAGGCAAAAAAAGTTTAATGAAGAGGATTCTAAAATGGTTTGGTTAGGAATGATCCATTACATGTAAATATATAACTTATTCCTTGTTAAATGGTGATCAGCCCAGAAATAATGGCATTTCAACTAAGTAAGTCGTTGTTAAATCTTTACCGTGAAAAAAGGTACTGCATTTGGATGTACTTAACAACCCATCGACGATGGCTCTTTATAAAAAAAAAATGTTATCGTCTTCGAGAGTTTACAGATTCCTGTCTTTCAAAATTTGATGATATAAATTCTTTTACACATTTTTACCCCTTTCTTATTATAATCATTTTTTAATGAGGACTTGTAAGGATGATTTTTTTTTAAATAAATGTTTTATTTGATATTGTGCACCACGTGGAAGTGACTTTTATCAGTAAATTGTGGAGTATTGTATTATATGTATAATAAAACTCAGATTGGTACTGTTTGTACATATAAA	S. purpuratus

mRNAs (5)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	JI424102 >JI424102\|>JI424102.1 TSA: Lytechinus variegatus isotig10888.Lvarbgast mRNA sequence AAACAGATGCAACCATACGATACTTGATTCTATACGGAGGACAGCGGCGATCATCACTTTAGACGCTCAA CTCACACAGAGAAACATTTACTCCGCTGATTTTCTGTCTTTTCATCTGTTGGAATTACACTGAAATACCT TCAAAATGAAGAAATATTTTAAATGCTGCTCAATGGCCATTTCGGCAAAATTCATCATGTTCTGTCTCTC AGTTCTCTTTTGGTGTGGTTCTGCTGGACTCATGTACCTCGGTATTGAGATGTTTACCTATGCTGGAAAC ATCCACCACCTTGCCAGTAACTATTTCTTGACCATCCCTGCCAGTGTATGCATTGGTCTCAGTCTTCTCT TCCTCGTTGTCGGTATTACTGGCCTTGTTGCTCTCACCAGGGATGATGCTCAGTGTTTGAGGAGGATGTT TGTTGCCTTGCTGATGGTTATTGTCATTCTGGAGATCACAGGAGCCGTCCTTGCTATTGTCTTCAAGGAA GAGATCAGCATGGGCATTGAGAGGGGTGTTAATAATACCATGACACATTACAATGAGAAAGAGAACTACC AGAGGTCAATGGACTATGTACAGGGACATCTCGATTGCTGTGGTTCCCACCATGCTGAGGACTGGACTAC CACACCATGGGGTAAAGCTCACCCTAACATGGTTCCATTGAGCTGCTGTAAGGACAACGCCACGGCCAAC TGCACAGGATCACTGGTCAACGAGCCATTCAACATCAACCATGACGGTTGTCAAGAAAAGCTTTATGAAG ACATCCGGGCATACCTTGTCTACATCATCATCATTGCAGTTTTTCTCTTCCTTTTACAGTCTATGGCACT CTGCTGCACTTGTTACTTGGTTTGTAAGAGACCAGACAAACACTACCAACAGATCCAGTCCTCCAAACGC GAGTCGAGCTATGGATACAAGGCTTAATCAACTACACGAATAGACTTTAAAGCATGAATGTTATCAAGAA GTCACAATCCCCCAAAGAAAATAGCCAGCTTGAATAATACAGAGATCATCCCAAGAACTGGAATGACGAT TTTTCTACCAATGGAGATACATTGCAAGTTTGCAGCACACGTTACCTGTTAATTGTTCTCACAGCTGTGT GAAAGTGGGGATGTCGCCATGTACTTGTTTTGTTATGGATTATCAGGGCCCTGTTGCAGGAGGAATTGAA ATCAATTGCAACGTGATGTAAGCCAATTAGAAGCGCGCCGTTGGACTTTGATTCTCATAGTTGCAATTAA ATGCAATTCTCCCTGCACAGGGCCTCTGGTCTGTGTTTTGCTGTTCTATGAATTTGGCAGTACATTCACT TTTGTCTTGCTCACTTCAATATTCCCTGTAATTTATTATTTTTTCCATAAGAGGTGCGATGTCATAAAGT AATTGAAATAATGGTGGTAAGATTGATTTTCAAATTCAAACCAGTGTCTTCATTTCTCACTCAGGTTGTT TCGTCCTGAAGAAAAAGTGTGTGTTTTAAATATAAACTTTTGTATCTATATTACTCTCTATGTGAATTTT GTAAGATTGTCTTCTTGGGATGGTATAACAAATGTGTGTGCTCATAGCATGTATATATTTGAAACTAAAT TCATTTCCCATTCACTGCCCCGGTGAAGACTAGAATATATTGGATGACTCTGTGGTGGGAATTGCCAATT GGATATCAAAAACAACTTATTTAATGTGTAATGCCCATTGGCCCATACATATTGGAGGACTAGGAGATCT TTAAATAGTGCAATTAACTGCACATTTTTTATTCAGTACATACATGCACACCATGACCAACCAATAATGG CTTTTTTAATCAAATATTCTCACCTTTTGAATGTCAAATGTTCTCACCTTTTGAATGTCAAATGTTCCAT TTTTTAAAAATTTAGACGAGATAGTAACTAAATCCTCTTCGAATAATTAGGAACTTTCTTGATATCATTT T	L. variegatus
	XM_041608659 >XM_041608659\|>XM_041608659.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus tetraspanin-36-like (LOC121415455), mRNA ACGCAAAACTCATGACCAATTGTCATTGCTCATACACAAATCGACCGCATCGTCTGCTATGTGTTTACCG GTGCTAGCGACCGAACAATAGGGGGGTAAACAAACAGATGCAACCATACGATACTTGATTCCATACGGAG GACAGCGGCGATCATCACTTTACACGCTCAACTCACACAGAGAAACATTTACTCCGCTGATTTTCTGTCT TTTCATCTGTTGGAATTACACTGAAATACCTTCAAAATGAAGAAATATTTTAAATGCTGCTCGATGGCCA TTTCGGCAAAATTCATCATGTTCTGTCTCTCAGTTCTCTTTTGGTGTGGTTCTGCTGGACTCATGTACCT CGGTATTGAGATGTTTACCTACGCTGGAAACATTCACCACCTTGCCAGCAACTATTTCTTGACCATCCCT GCCAGTGTATGCATTGGTCTCAGTCTTCTCTTCCTCGTTGTCGGTATTACTGGCCTTGTTGCTCTCACCA GGGACGATGCTCAGTGTTTGAGGAGGATGTTTGTTGCCTTACTGATGGTTATTGTCATTCTGGAGATCAC AGGAGCCGTCCTTGCTATTGTCTTCAAGGAAGAGATCAGCATGGGCATTGAGAGGGGTGTTAATAATACC ATGACACATTACAATGAGAAAGAGAACTACCAGAGGTCAATGGACTATGTACAGGGACATCTCGATTGCT GTGGTTCCCACCATGCTGAGGACTGGACTACCACACCATGGGGTAAAGCTCACCCTAACATGGTTCCATT GAGCTGCTGTAAGGACAACGCCACGGCCAACTGCACAGGATCACTGGTCAACGAGCCATTCAACATCAAC CATGATGGTTGTCAAGAAAAGCTTTATGAAGACATCCGGGCATACCTTGTCTACATCATCATCATTGCAG TTTTTCTCTTCCTTTTACAGTCTATGGCACTCTGCTGCACTTGTTACTTGGTTTGTAAGAGACCAGACAA ACACTACCAACAGATCCAGTCCTCCAAACGTGAGTCGAGCTATGGATACAAGGCTTAATCAACTACACGA ATAGACTTTAAAGCATGAATGTTATCAAGAAGTCACAATCCCCCAAAGAAAATAGCCAGCTTGAATAATA CAGAGATCATCCCAAGAACTGGAATGACGATTTTTCTACCAATGGAGATACATTGCAAGTTTGCAGCACA CGTTACCTGTTAATTGTTCTCACAGCTGTGTGAAAGTGGGGATGTCGCCATGTACTTGTTTTGTTATGGA ATATCAGGTCCTTGTTGCAGGAGGAATTGAAATCAATTGCAACGTGATGTAAGCCAATTAGAAGCGCGCC ATTGGACTTTGATTCTCATAGTTGCAATTAAATGCAATTCTCCCTGCACAGGGCCTCTGGTCTGTGTTTT GCTGTTCTATGAATTTGGCAGTACATTCACTTTTGTCTTGCTCACTTCAATATTCCCTGTAATTTATTAT TTTTTCCATAAGAGGTGCGATGTCATAAAATATTTGAAATAATGGTGATAAGATTGAATCTTCAAATTCA AACCAGTGTCTTCATTTCTCACTCAGGTTTTTTCGTCCTGAAGAAAAAGTGTGTGTTTTAAGTATAAACT TTTGTATATCTATATTACACTCTATGTGAATTTTGTAAGATAAATGTCTTCTTTGGGATGGTATAACAAA TGTGTGTACTCATAGCATGTATATATTTGAAACTTAATTCATTTCCCATTCACTGCCCATGAAGACTAGA ATATATTGGATGACTCTGGTGGGAATTGCCGATTGGATATAAAAAACAACTTATTTAATGTGTAATGCCC ATTGGCCCATACATATTGGAGGACTACGAGATTTTTAAATAGTGCAACTGCACATTTTTTATTCAATACA TACATGCACATCATGACCAACCAATAATGGCTTTTTTAATCAAATATTCTCACCTTTTGAATGTCAAATG TTCTCACCTTTCGAATGTCAAATGTTCCATTTTTTTTTAAATTTAGACGAGATAGAAACTTAATCCTCTT CGAATAATTAGGAACTTTCTTGATATCATTTTATAATGAAGATCTGTTACCATGCTTTTATTTCTTTTAT ATATTTATGAATATCTCATTTGATATCATGCACCATGTGAAAGTGAAGTTAACACAAAGTACTATGTATT GTTGTATTATATGTATATTAAAACTCAGATTGTTCATATA	L. variegatus
	JT103979 >JT103979\|>JT103979.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.647702.0 mRNA sequence CATCGTTCCATTCCAGCGCATTCATTCATCATCTCCGTAGCACACACACACAAAACTCACTACCAATTAT CGTAGTCAGACCAGTTCGCCTGCACTGAGTATACCGGTGCTAGCGACCGAACAATGAGGGTGTAAACAAA CAGATGCAACCATACAAAACTTGAGCACACGGCACACTGCGTTCGATCGTCACTAGATCGCAAATCCATC TCCGAGAGCAACACGTACTCTGAAAATTTTCTGCCTCACATCTGACGGAAAAACACTGAAATATATTCAA AATGAAGGTCCTTAAATGCTGCTCCATTGCCCTGTCGGCAAAATTTATCATGTTCTGTCTCTCAGTCCTC TTTTGGATTGGTTCTGCTGGTCTCATGTACCTCGGTATTGAGATGTTCACATATGCCGGAAACATCCACC ACCTCGCCAGCAACTATTTCCTGACCATCCCTGCCAGCGTGTGCATTGGTCTCAGTATTCTTTTCCTGAC CGTCGGTATTATCGGACTCATCGCTCTTACCAGGGAAGATGCTAGGTTCCTCAGGAGAATGTTTGTTGCA TTGCTAATGGTTATCGTCATTCTGGAGATTACAGGGGCTGCCCTTGCTATTGCCTTCAAGGAGGAGATCA ACACGGGTATTGACAATGGACTTAATAACACCATGAAACATTACAATGAGAAAGAGAACTACCAGAGGTC TATGGACTATGTACAAGGACATCTTGATTGCTGTGGATCCCACCACGCTGAGGACTGGGCCACCACTCCA TGGGGCCACGCTAACCCTGACATGGTCCCTCTTAGCTGCTGTAAGGATAACGCTACAGCCAACTGCACGG GGTCACTCGTCAACGATCAGTTCAACATCAACCACGATGGTTGTCAAGAAAAGCTTTACGATGACATCAA GGCTTATCTTGTGTACATCATCATCATTGCGGTTCTTCTCTTCCTTTTGCAGTCTATGGCCCTCTGTTGT ACCTGCTACTTGGTGTGTCACCGACGGGACAAGCAATACCAACAGCTTCAGACACCCTCCAAGCGTGAGT CAAGCTACGGGTACAGGGCATAATTCATCTACAGAAAAAGACTATTACCAGACGCACAAATGTCATCAAG AATCATTGATATCCCCAAAATCATCTACAGAAAAAGACTGTTACACACAAATGTAATCAAGAATCAGTGA TCTCCCAGTGTGATTGTCAACCCTGATATATGGACACCTCTACAGAAGGGCCACCTGTCTAGAAAGGCCA GCATGTTCTGCATTCGCAATGATATATATTACAGCACAACATGTTGCAGGGTATTCATTGGCGTAACTGT CTGAAAAATAGAAAGGTCTGGGGGGGGGGGGTTTGGAAAAGTTATCCAGATCTATCCATTTGTGAATTAA AAATGGATTAACTTTTTCTTTTTGGAGTTCCAAGAATTTACTCAAGTCGCACTTCTTGCTTATTCTAACA TTCCATGCTCTTATTTTTTGTTTATCTTGAGTTTACAGTATTTAATATTGACACCATAAATTCACAAACT GAGGATCAGCAAAAGACTATGATTATTTAGGTATATGTTAGATAATGAATTTCATTGGCTAGTCAGAGTA AAT	S. purpuratus
	GHFM01018482 >GHFM01018482\| -	S. purpuratus
	XM_781932 >XM_781932\|>XM_781932.5 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus tetraspanin-36 (LOC581955), mRNA AATCGACCAGTTCGCCTGCACTGAGTATACCGGTGCTAGCGACCGAACAATGAGGGTGTAAACAAACAGA TGCAACCATACAAATCTTCAGCACACGGCACACTGCGTTCGATCGTCACTAAATCGCAAATCCATCTCCG AGAGCAACACGTACTCTGAAAATTTTTTGCCTCACATCTGACGGAAAAACACTGAAATATATTCAAAATG AAGGTCCTTAAATGCTGCTCCATCGCCCTGTCGGCAAAATTTATCATGTTCTGTCTCTCAGTCCTCTTTT GGATTGGTTCTGCTGGTCTCATGTACCTCGGTATTGAGATGTTCACATATGCCGGAAACATCCACCACCT TGCCAGCAACTATTTCTTGACCATCCCCGCCAGCGTGTGCATCGGTCTCAGTATTCTTTTCCTGACCGTC GGTATCATCGGACTCATCGCTCTTACCAGGGAAGATGCTAGGTTCCTCAGGAGAATGTTTGTTGCCTTGC TAATGGTTATCGTCATTCTGGAGATCACAGGGGCTGCCCTTGCTATTGCCTTCAAGGAGGAGATCAACAC GGGTATTGACAATGGACTTAATAACACCATGAAACATTACAATGAGAAAGAGAACTACCAGAGGTCAATG GACTACGTACAAGGACATCTTGATTGCTGTGGATCCCACCACGCTGAGGACTGGGCCACCACTCCATGGG GTCACGCTAACCCCGACATGGTCCCTCTTAGCTGCTGTAAGGATAACGCTACAGCCAACTGCACGGGGTC ACTGGTCAACGATCAGTTCAACATCAACCACGATGGTTGTCAAGAAAAGCTTTACGATGACATCAAGGCT TATCTTGTATACATCATCATTATTGCAGTTCTTCTCTTTCTTTTGCAGTCTATGGCCCTCTGTTGTACCT GCTACCTGGTGTGTCATCGACGGGACAAGCAATACCAACAGCTCCAGACACCCTCCAAGCGTGAGTCAAG CTACGGGTACAGGGCATAAATCATCTACAAAAAAAGACTATTACCAGACGCACAAATGTAATCAAGAATC ATTGATATCCCCAAAAATCATCTACAGAAAAAGACTGTTACGCACAAATGTTTACCAGAATCAGTGATCT CCCAGGGTGTTTGACAACCTTGATATAGTGGACACCTCTACAGAAGGGCCACCTGTCTACAAAGGCCAGC ATGTTCTGCATTCGCAATGATATATATTACAGCACAGCATGTTCCAGGGTATTCATTGGCATAACTGTCT GAAAAAATAGAAAGGTCTGGGGGGTTTTTGGAAAAGTTATCCGATCTATCCATTTGTGAATTAAAAATGG ATTAACTTTTTCTTTTTTGAGTTCCAAGAATTTACTCAAGTCACACTTCTTGCTCATTATAACATTCCAT TTTCTTATTTGTTGTTTTTCTTGAGCTCACATTATTATAAATTATCTTGACACCATAATTAGCTAACTGA GGATCAGCAAAAGACTATGATTATTTAGGTATATGATTGATCATGAATTTCATTAGTCAGAGTAAATAAT GTTTCTTTGTAGGCTGAGTAAAGAAAATGTCTTTTTATGAGATAGCAAATAGTGTTATGAAAAACATGGA GTAATTGCCTTCACTTAAACATTATTTGTGTCACATGTTGTGCTTTATAGTCGGATGTTTTTCTAAAACA GGTGCAAGCTTATAGAAAGTAATGGTGATTTCGTGATAGAAATGAATTTTTAAGAAACGTGTAAAAGCAA GTGTCTTCTGTATGTCACTCAGGTTTTTTTTCGTCCAGAAGAAAAGTGTGTGTTTCTAAATACATGTTGA CTTTCATATTGTGCGAAACCTTTTAATACCCTACATGTATTTTATCTTTGGGATGGTATTATAAATGTGT GTGCCTGTAGCATGTATTTATTTGAAAATGGTCATTCATTTTGAAGATTGTGGAGTGCCAGGATTGTCGA GTCTGACATGAGCACCATACAAGAATCCCTTATTATTATTATTGTTAATATTTCCAATACCCTGCCAAAG TGAAGGCAAAAAAAGTTTAATGAAGAGGATTCTAAAATGGTTTGGTTAGGAATGATCCATTACATGTAAA TATATAACTTATTCCTTGTTAAATGGTGATCAGCCCAGAAATAATGGCATTTCAACTAAGTAAGTCGTTG TTAAATCTTTACCGTGAAAAAAGGTACTGCATTTGGATGTACTTAACAACCCATCGACGATGGCTCTTTA TAAAAAAAAAATGTTATCGTCTTCGAGAGTTTACAGATTCCTGTCTTTCAAAATTTGATGATATAAATTC TTTTACACATTTTTACCCCTTTCTTATTATAATCATTTTTTAATGAGGACTTGTAAGGATGATTTTTTTT TAAATAAATGTTTTATTTGATATTGTGCACCACGTGGAAGTGACTTTTATCAGTAAATTGTGGAGTATTG TATTATATGTATAATAAAACTCAGATTGGTACTGTTTGTACATATAAA	S. purpuratus

ESTs (0)