LOC586828 Nucleotide Sequences

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Echinobase

Gene Literature (0)

Nucleotides (7)

Interactants (0)

ECB-GENEPAGE-23072483

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for LOC586828 - All

RefSeq mRNAs(3)

Models - Gene (2)

Models - mRNA (1)

mRNAs (5)

ESTs (0)

RefSeq mRNAs (3)

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Models - Gene (2)

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variegatus

mRNAs based on gene models(1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	XM_011664952.2 >XM_011664952.2 CGGAAGTACATTTTTCAATGACGTCACATAGCTTAGTTACAGAAAGCGTTTCCATTTATTTGTCTCCGGATTTAGGCTATCTATTATATCTACAATCATGCCTGGGCTATTAGATTTATTACGGAAGATGAAGCGTAAAGACACAAGGGAGCTACGCGTTCTCTTACTGGGTCTGGACAATGCTGGCAAGACTACCATTCTAAAGTTCCTGTCAAATGAAAGCCACGACAACATCTCACCAACACAAGGATTCAACATCAAGAGTGTAAACGCAAATGGCTTGAAATTGAATGTCTGGGATATTGGAGGGCAGCGGAAACTAAGACCGTACTGGAAGAATTATATCCAAAGCACAGATGTGTTGATCTATGTGATAGATAGCTGCGACAGGGACAGATTTGAAGAAACTGGTCTGGAACTCCAAGATCTTTTAGAAGAAGAGCCCTTACAGGGAACACCTGTGTTGATATATGCCAATAAGCAGGATTTGCTTGGCGCTGCAAGTCCAGCGGACCTTTCAGATGATGAAGCCCTTAGCCTTCGTTCAATACGTGGCAGGGCATGGCAAATACAAAGATGCTCAGCGCTCACTGGAGAGGGCTTAAAGGAAGGTATGTTGTGGGTGATGAAGAACTCGAGCTCGAAGACCTCGAGCACAAAGAAGTAAGAGACCTCGAGCATCAGCCTCTTCTAGTTATGAACAGGACAGTATATGAAGAGGATCTTAAATCATCAGGAAACCGGTCATCGCAAGCTCACACGCAATGGTTGTTAGGACTTTGGTGTTCTTGTAAAACCAGTATCACCTACAAATATGTACCTATACAACTTTATTTAATCCAAAACCTGTCAGTAATAATGAGTCAACAGTTTTGAGTCTCTTGATACACACATATACCATGTAGTAAGCTACATGCATGTGTACAAGAATGCTGTCATGGAAGGTATTGTCGGCTCATTATACAGACTGCGTTTTGTAGCCCAAGCTCATTTGCTTCTTTAGCACATACTGTATCATCACATCATAATCACAAGGATGGGACAATCCGTATGTGATTTTTTTCATGATAATTCTTCTCCACAATTACATTATGCCTGTTAATGATTCCTATTATAGAATATTCATGGTACCCTATCACATAATTGGAAAAGAGTAATCTTTGTTATCTTTTTCAATTCCCACTTGCACAAAAATGCAATGAATGTAGCAATCTTACAATTTTAAAATGAGCTGATTGTTATAATTTTTTTTAATATTTGAA	S. purpuratus

mRNAs from cDNA libraries (5)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	XM_041621892 >XM_041621892\|XM_041621892.1 PREDICTED: Lytechinus variegatus ADP-ribosylation factor-like protein 3 (LOC121425723), mRNA ACATGCCGCACCAATTTGGGTCCGGTTTGACGTCACATAGCTTAGTTACAGAAAGCGTTTCTACTGATTTCATCACTGAATTGGTTTCTTATACCTCTAAGAATGCCCGGGTTACTAGATTTATTACGAAAGATGAAGCGGAAAGACAAGAGGGAACTGCGTGTTCTGCTCCTAGGTCTGGACAATGCTGGAAAGACGACCATTCTGAAGAAATTAGCGCATGAAGAGGCTCAAAATATCTCGCCCACAGAAGGATTCAACATCAAAAGTGTAGCATCGGGAGGTATAAATTTAAATGTTTGGGATATTGGAGGACAACGGAAACTTAGGCCGTACTGGAAAAATTATTTCCAAAACACAGATGTTTTAATCTATGTGGTAGATAGTGCTGACCATGGAAGATTTGAAGAGACAAGTACGCAACTTTCTGATTTGTTGGACGAAGACGGGTTACAAGGGGTACCTCTATTAGTATACGCCAATAAACAGGATCTTCTCGGTGCTGCATCTCCGGCAGAGATCTCGGATGCGAAAAACCTTGATCTTCAAAGAATACGTGATAGGGCATGGCAAATACAAAGTTGTTCGGCTGTTACGGGAGAGGGTTTAAGCAAAGGTATGGAGTGGGTTATGAAGAACATGAAGAAGTAAGAGAGCTAACAATCATCCTAAGCTAAAGGCTATAAGTA	L. variegatus
	GAUR01052334 >GAUR01052334\|GAUR01052334.1 TSA: Lytechinus variegatus AMR9006.36573.0.1 transcribed RNA sequence GCTGAAAACTGCTTATCTAAAAACAGATTTGAAGATTTGAAGTTGTAGGGTTGAATACAAAACAAGATACAAGAGATTCTTTGATGCAGACTCCTTGGAAGTTAAATTGAGATTGCACAATGTGCCCCTGAACTTCAAACATTTTCTCCTTATTTCGTGAAGCTCTCTTTTAGTATCTTCAGCATTCAAACAAGTACTTGAGGAGGTCGTTGTTGATCAATTTCGAGTTATGTATCATTTCAAAGCTCAGGAAGTAGTTTTTCAAGCTCAATAAAAATCTCATAAAAATTCTTTTGCTTTGGGGGTAGCTGGTCACATATACCATCTTGGGTGACTTCATACACACTTTTAAAAAAGTAATATACATCTCCCTGCCCTTACTTTACTGGAGGAGAGGAAATCTCCAAAATATCACACAGGATGACTGGAGAAATAGGGATATTTTTTTTTCAGAGATGTGTGCAGAGTCACGGGGTCACAGAAATAGCTACAACACCTGCTTTTAAATTCTACAATTCAATGCCGAAAACACATGATAATCCTGAGCAATAATCTGTTATCATCAGTGATGCGATCCATAATAGTGCAAAAGTCTCTAATTATATCAATCACTGTGTGACTCTGAATGTATGTAAACTTGCAAATGCATTTTGCGATGACTCCTCTGGTGCGAATGCATCCAAACTTGTATACTGATATATCAACTGGTGCCAATGAGTGTCTTTGTGTACCTTTCTTACTGGTTTATCCACAAGTTTGTATGCATGTAAGCTCGAGTATTAATCAGTGAATGTGTGCAAACCCTTTATATTGTCAATGCATGCAAACCTGTATTCATTTTGAGAATGTGAACAGCCTCAAGGGTGATGTGAATGCATGCATATTGATTTCACTGAAATACCAACCAGACTGAATGCATGCTAAGCCCAATACGGATATTGTGAATGTGCGTGAACCCCTTGAATGGAAGTGTGAATGCATGTACTTCCTTTTTAGTGATACACCATCCAGTGTGAATGACTGTATACAACCTCCTGCACTGAAATATCTAACAAGTGTGAATGCATACAAACTTAATATAAATCAGTATGGACGCAAAACCCGTTTACACCAGGGGGAATGTATGCAAGCTCCTATATATATATATATATCAACAAGCATGAAAATCACAACCCCTTGGTGGAAAATGTAAATATAGTGTGATATATCAACAAGTGTGAATGAATCCAATCCTGCAATGGTCAGTTTACTGATGAATTACGACCTCCTTCACACTCTCTACTTATAGCCTTTAGCTTAGGATGATTGTTAGCTCTCTTACTTCTTCATGTTCTTCATAACCCACTCCATACCTTTGCTTAAACCCTCTCCCGTAACAGCCGAACAACTTTGTATTTGCCATGCCCTATCACGTATTCTTTGAAGATCAAGGTTTTTCGCATCCGAGATCTCTGCCGGAGATGCAGCACCGAGAAGATCCTGTTTATTGGCGTATACTAATAGAGGTACCCCTTGTAACCCGTCTTCGTCCAACAAATCAGAAAGTTGCGTACTTGTCTCTTCAAATCTTCCATGGTCAGCACTATCTACCACATAGATTAAAACATCTGTGTTTTGGAAATAATTTTTCCAGTACGGCCTAAGTTTCCGTTGTCCTCCAATATCCCAAACATTTAAATTTATACCTCCCGATGCTACACTTTTGATGTTGAATCCTTCTGTGGGTGAGATATTTTGAGCCTCTTCATGCGCTAATTTCTTCAGAATCGTCGTCTTTCCAGCATTGTCCAGACCTAGGAGCAGAACACGCAGTTCCCTCTTGTCTTTCCGCTTCATCTTTCGTAATAAATCTAGTAACCCGGGCATTCTTAGAGGTATAAGAAACCAATTCAGTGATGAAATCAGTAGAAACGCTTTCTGTAACTAAGCTATGTGACGTCAAACCGGACGTATTG	L. variegatus
	XM_011664952 >XM_011664952\|XM_011664952.2 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus ADP-ribosylation factor-like protein 3 (LOC586828), mRNA CGGAAGTACATTTTTCAATGACGTCACATAGCTTAGTTACAGAAAGCGTTTCCATTTATTTGTCTCCGGATTTAGGCTATCTATTATATCTACAATCATGCCTGGGCTATTAGATTTATTACGGAAGATGAAGCGTAAAGACACAAGGGAGCTACGCGTTCTCTTACTGGGTCTGGACAATGCTGGCAAGACTACCATTCTAAAGTTCCTGTCAAATGAAAGCCACGACAACATCTCACCAACACAAGGATTCAACATCAAGAGTGTAAACGCAAATGGCTTGAAATTGAATGTCTGGGATATTGGAGGGCAGCGGAAACTAAGACCGTACTGGAAGAATTATATCCAAAGCACAGATGTGTTGATCTATGTGATAGATAGCTGCGACAGGGACAGATTTGAAGAAACTGGTCTGGAACTCCAAGATCTTTTAGAAGAAGAGCCCTTACAGGGAACACCTGTGTTGATATATGCCAATAAGCAGGATTTGCTTGGCGCTGCAAGTCCAGCGGACCTTTCAGATGATGAAGCCCTTAGCCTTCGTTCAATACGTGGCAGGGCATGGCAAATACAAAGATGCTCAGCGCTCACTGGAGAGGGCTTAAAGGAAGGTATGTTGTGGGTGATGAAGAACTCGAGCTCGAAGACCTCGAGCACAAAGAAGTAAGAGACCTCGAGCATCAGCCTCTTCTAGTTATGAACAGGACAGTATATGAAGAGGATCTTAAATCATCAGGAAACCGGTCATCGCAAGCTCACACGCAATGGTTGTTAGGACTTTGGTGTTCTTGTAAAACCAGTATCACCTACAAATATGTACCTATACAACTTTATTTAATCCAAAACCTGTCAGTAATAATGAGTCAACAGTTTTGAGTCTCTTGATACACACATATACCATGTAGTAAGCTACATGCATGTGTACAAGAATGCTGTCATGGAAGGTATTGTCGGCTCATTATACAGACTGCGTTTTGTAGCCCAAGCTCATTTGCTTCTTTAGCACATACTGTATCATCACATCATAATCACAAGGATGGGACAATCCGTATGTGATTTTTTTCATGATAATTCTTCTCCACAATTACATTATGCCTGTTAATGATTCCTATTATAGAATATTCATGGTACCCTATCACATAATTGGAAAAGAGTAATCTTTGTTATCTTTTTCAATTCCCACTTGCACAAAAATGCAATGAATGTAGCAATCTTACAATTTTAAAATGAGCTGATTGTTATAATTTTTTTTAATATTTGAA	S. purpuratus
	GHFM01021111 >GHFM01021111\| -	S. purpuratus
	JT098963 >JT098963\|JT098963.1 TSA: Strongylocentrotus purpuratus WHL22.53647.0 mRNA sequence ATTGTATCCCACAATGCACAATAAATATGAGCTCTATCCGAATTCCGGAAGTACATTTTTCAATGACGTCACATAGCTTAGTTACAGAAAGCGTTTCCATTTATTTGTCTCCGGATTTAGGCTATCTATTATATCTACAATCATGCCTGGGCTATTAGATTTATTACGGAAGATGAAGCGTAAAGACACAAGGGAGCTACGCGTTCTCTTACTGGGTCTGGACAATGCTGGCAAGACTACCATTCTAAAGTTCCTGTCAAATGAAAGCCACGACAACATCTCACCAACACAAGGATTCAACATCAAGAGTGTAAACGCAAATGGCTTGAAATTGAATGTCTGGGATATTGGAGGGCAGCGGAAACTAAGACCGTACTGGAAGAATTATATCCAAAGCACAGATGTGTTGATCTATGTGATAGATAGCTGCGACAGGGACAGATTTGAAGAAACTGGTCTGGAACTCCAAGATCTTTTAGAAGAAGAGCCCTTACAGGGGAACACCTGTGTTGATATATGCCAATAAGCAGGATTTGCTTGGCGCTGCAAGTCCAGCGGACCTTTCAGATGATGAAGCCCTTAGCCTTCGTTCAATACGTGGCAGGGCATGGCAAATACAAAGATGCTCAGCGCTCACTGGAGAGGGCTTAAAGGAAGGTATGTTGTGGGTGATGAAGAACTCAAGCACGAAGACCTCGAGCACAAAGAAGTAAGAGACCTCGAGCATCAGCCTCTTCTAGTTATGAACAGGACAGTATATGAAGAGGATCTTAAATCATCAGGAAACCGGTCATCGCAAGCTCACACGCAATGGTTGTTAGGACTTTGGTGTTCTTGTAAAACCAGTATCACCTACAAATATGTACCTATACAACTTTATTTAATCCAAAACCTGTCAGTAATAATGAGTCAACAGTTTTGAGTCTCTTGATACACACATATACCATGTAGTAAGCTACATGCATGTGTACAAGAATGCTGTCATGGAAGGTATTGTCGGCTCATTATACAGACTGCGTTTTGTAGCCCAAGCTCATTTGCTTCTTTAGCACATACTGTATCATCACATCATAATCACAAGGATGGGACAATCCGTATGTGATTTTTTTCATGATAATTCTTCTCCACAATTACATTATGCCTGTTAATGATTCCTATTATAGAATATTCATGGTACCCTATCACATAATTGGAAAAGAGTAATCTTTGTTATCTTTTTCAATTCCCACTTGCACAAAAATTCAATGAATGTAGCAATCTTACAATTTTAAAATGAGCTGATTGTTATAATTTTTTTTAAATATTTGAATTATTACTATTATTTTATGTTATTTATTTATTATTATCATTATGTTTTATTTTATTTTATTGATTATTATTTCTCTTTATGGGGGGGGGGGGGGGTGGAGAGAATTTTGACCAGAAGAAATGTGCAAGAAGTAAAGGGTTGCGTGGATCCTAAGTTGTTGAGTTTACCTTTTAATTGATACATTTTTTTAGAATTCTAGTTTTATATATATGTAAGTAGTAAAATGGAGGTAGAGTTGTCAATGGTATACCTTTATTATGTAAATTGATGGATGCTTTTTTTTCACCACCATTTCTCCATATTTTCCTCCATTTGTGTGTATTTCATGTCAAACATCACCAAAAAATACATGTTGTATGAAGTGTTCAGGACCCATATTCATACAACCTTACTGAGCTTGTTGTCAACTAATACATATGCCATATTACATGTACATACTTAGATGATAACTAGGCTTGGTAAGGGTCTATAAATATGGGCCCTAAAATTAAACTCATCTTAATTGTCCCGTGTTATTATTATTATTAATTCTTTTTATATCATGTGAAGGTACTGAGCCAAAGGACAGAATGTGCAGACCTGTGTATTCATAAAATGTACAACATTGTATTAATTGCTTTTGATTAGGTTGGTTTATGTAATAGGGTGTTTCTCTTAAATTAGATGTGTGCATGTTGTGTGTTTGAAACTTCGTTTTTAGAATAGGACAATGTCTTTTCACATTTCTCTCATCTTCCATAGGTCCGTATTCATCAAAGCTAGTCCGAAAAGATATAACAGGCTAAATCATACAAGACATGTACATATATGTGGTTTATCCTCAGTGAGCTGTGGACATGTTCATACATGGTTTTCTGAATATTGGCCCTGACTTTGACTAATAACTTTTCACATCTGTACAGTCTGTAAGTACTATTTCAGTATTCATGTCAACGTGCATTGATTGTAATTGTAATCACCTTGAGTTTTAATTCCTGCCTTTAAATAATTGAGTATTTATTTTCGCAATACAGATGTTCTCCCATAATTTGGAATGTAAAAGTAAAACATGTAAAATTCAGATGTGGATATTGTAGGAAATTTGAGATAGGTTTCCTTTACATCAGCGAAATATAATTATCTGAAAACCTGTTTTCAATTGTATTCACTTATGATTCGAAGTGGGTCATGCACTTATAAGTTCCTGTACTCTTTTTCAATTCCTTGGTAAAGATTATTACCCAACATGTTGTCAATTAGGTGTGTGACTCCATCAACTTTTGGTCAATATAATGCTCAACTTTGATCACTTTACACTGCAAATTTGCATATTGCACAAATCACCCAAATTAGGCATGTAATTGCCTGTAAGTTGTGCAAACACAATATATGCTTTTTTATGTGGGGTACTGTTTGTGCAAACATGAATAATAGTTTCACTTGAAACAAGTATATTATTTGATGAAATCATATAATCTACTTGAGTTACATTTTGCATCAGAAATGTGGATAACAACATGTACCAGTAGGCAAATTGGATAATAAGTTAGAATTGTGAACAAAGCTAATACATGTAGTGCTTTCACATTGTGTTCATGGTGATGTTGAAAATTATACATTGTAGTTTAATTAGAACTGTGAAGTTAACTTTTTACTTTGCAAAATGGGATCTTTCGTTTATTTAGACTCGGCGTTGGTAAATTGTATATACATTCAAAACTAAAGGTAGATTGTCTTTGTATTTTGTTGTGTTTTTCTCTAGAGCGCTTAGGGACATGTTTTAATACTATGTGTTATGCGCTATACAAGAATGGTTAATTATTATTATTATTATTAGATAGTCATTTCGTTTGAAGGGAGAAGATATGTATATCTACATACCAAATCAAGTGACTGAGAGATTTAAGTGTTTGTCTTTTACTCCCTTCTCCTTCTATTCATCTGTTCCATACAATATTCATCACAGGGATGCCAGTTTTCAGGCCCTGGCGAGTTATTTTCAGATCATAGTTTAGGCCTTTTTGTGTTCAAAATAGCTCATTCTAGGTGATTTTTAGGCCCTCTGATCAATTCTAACTGGCATCCCCATTTATCAGTGGGTGAGTACAAGGTATGTCCCATAGGTGGAATTGTGAATAGTAACTAACATAAAAATAACAATTTATTTGATGTTTTGTCTGATTCAAACTGATACAGTCAGTAACGTATGGGACAGTCATAAAATAGCAAGGGCTGCGTTTTATAAAGAATGTGATGTATAATTCATTGCTAAGTTACGATGTTAATTTATCATTAGCAGCTCACTTATTCAGTATGAAGTACTTGGAGTAAGCTATACATTGTTATTGGAGCACATGATATAGTTATTTAGACATTGCATTGCCTAACATACAGTTTATGTCAATAGTAGATGTGAAGAAAGTCCAATGTTGATATCATTTCGTGAGCATGCATGTAATAATGCTGGATCAGTTATCAGAATCCATTTGTATTACGAGGGAAATACACGCCGGTAGTGAACGTATACAGACTGAAACACCCACATTTTATGATTATGTTCTAATGCAAATCACCCAAACACCCTCCTTAATGTAAATGTTGCTTACATTGAAGAATTATATGTTAATTGGTAGATAATTATATGTTTTCATGGATATACATATACATGTATATAGCTTACTCAGGCATTTGGATGTTATCTTAGTGTTGGTTCGGCTCGGCTCTAGACTTTCATTAGAAAGTGGCACAGACATGAACCTCAAGTATTTGATGGGGACTGTACAGAATAGAGATAAACAATTAGATTGTATTTGTTGTACCATTAGTAAGTGTGAGTATTATTTTTGAGCTGCTTTTACAAAAAAAAAATCATTTGTGATAGAACCACTGGCAATATTTCTACCTTTTTATGTTTAATATAGATTATAATTATAC	S. purpuratus

ESTs (0)