LOC115922680 Nucleotide Sequences

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Echinobase

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ECB-GENEPAGE-23012831

Show: All S. purpuratus L. variegatus P. miniata A. planci

Nucleotide sequences for LOC115922680 - All

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Models - Gene (1)

Source	Version	Model	Species
NCBI_REFSEQ/JGI	5.0	LOC115922680 >LOC115922680 CAAGACTATACATGCTCGCATCTAGTTTGCTATTTCAAACGGGAATGTGTACGTACGTGTGTGTACAGGTACATTCAGCACTCAAGGCAATGCGTAGGACTACAATGCATTGCATTGCACGATGTGTATGTAATGTATTTGAATTCAGAGTGAAAAAGCCGTTGCAAGAAGTATCCTCCTCCTGAATACTCCAGTTTTCTCCTGCAAATTTACAGTATGGGTAAGTCCTAGAATTACCTAATTTATTTACGAAAAGTACATAAATCTATAGTTACTGTTTTTTATTCTGAAAAGTTGATATGTAGACTCTTTGTTACTGTAATGCATGATCTTATGTCAGTGATAGTGAGCTCGGACTTTCAACTTTTGCTGACTAGATTCGAAATGTATGATCCCATATATGTATTTTTATGTAGGGTTTTGATTGATGGGATGCATGGCATGGGGCATCATTTAAAGCAAAAAAGTTTACTCATTTGCCTACACATGGGCTGCATGGCTTTAAAGGGAAATCTAACTCGAATATAGTATTATACAACTGCTCTAAAACTGAAAGAAAGCAGAAAAATAAGAGAAGCAAACTGATGAAAGTTTTGGCACTAGGTAGGTCTAGATCTACTGCTAAGTCACACTAAGATGGATAATACGTGCAGTCACTCCTTTATTCCAAGCAATACTGTAGATCTACTACTAGTTCAGAATCATATCCAGACTTTTTGACCAGTGACCCATGGCGTGGCCGGTGAGAGTCCTAAAAATCTTAAACATAGGTCTAGATCGGCCTACCCCAAATCAAGCAAATATTCATGAAATGTTCAAATAATGCCAGTCATGATTTAAAAGTCGTTATGTTTCTAACCTGTTTCTGGTCAATTTTTCTTATTTTGGGGGGAGTATTTTTCGGGAAAAACGTTGATTGTAGAATACACTTTCTGACAGGTTGCACGGCAAACCGCTGCACAATACAAGTGCATACAGATGGAGGGTTGCGGGGGCACGTAAGTCTGCGTGAAGTGATCTACCTCCTCATTGTACGGTAGATAACTTCACACAGGCGTGCACCCGCCCGCAACCACCATCGGTATGCACTTGTAATGTGCAGCGGTTTACAGTGAAACCTGTGAGAAAGTGTACTATAGTACCGGCCCAGGCCCAGATGTTTGAAAATTGAACATTGCGTGTCGATACGTAGAGGAATAAAGCAGTGACTTGTGTCACAAACATGTAACCTTAAACAATTTGTTTCTACAGTCTTTAGACAGCAAATTTAGCTTATAGGCTACCGTATACAGAAATCTTATCTGGAAATAGTCGGTTAGACCTGTAAATGGTAACCAAAATTCTTTCCCCACAGGCTGTTCAAAGAAGCTTGTAGTATTTGTGTTGCACATGCATACATTATCAACCTTTCATTTTGTTTTAACTTTATTCATTTTCTCATTTATTTGTAGGCATCTTTTTTTAACATCTTTCGTCAAAGAAGTGGATTCAAAGCACATTGTGGCCTCAGTATATTGATGTGAAACCATGCAGAAAATGCTACTTTCTCTCAACCTTGTGGATGTTCCCTACTTCCCTAAGGATCAGCAGCCTCTTGAAACAGGTGAAGCCATTATCGGTAAATGTGTACATGTACTTGTATTATTTCTGTACATTTATTTGTCATATTGTGCATGATCACTGAGACACTGACGAATTAGACACTACATAATGGTTCATTTCATTTGAAAGGCTTATTTCAGTTATTTGTCCTAAGTTTCAAATATATTTATAATTCAATTAATTTTAGATCACTAAAACCTGCAGGTATGTTGCAATAACCGACAATATTATGTGAGTTTCAAACAGTGTTTTTTTACCCTTCAGCATAGGTCAAGGAGCTTTCATTCTACCCTCATCAGCAAACTACAGGAATGCCAGTTTTCAGGCAATAGCCTGAATTCAGGCCCTGAGGAGTTATTTTCATACCATAGTTTAGGTTTTTTGTGTACAAGCTAGCTCATTCTAGGTGATTTTTCAGGTCCTCTGATCAATTCTAACTGGCATCCCTGAAACTAGAATTGTATTGATAATTAACCAAACAAAATCCCGAATCACGTTTTGCATTGCCCACAAATGTTTAAAACCCAAAGGTGTGTTGACTTTATGTTTGTGAGCAATAAGAAATTATTTCTGATAAATCTTACCAAGCAGTACTTTTCTGACAGAATTAATTATTTACGTTCCAGTTTTAAAATATATGAAAGTTTTTCTTAAATTGTATTCCTTTCTTTTTGCTTTATTCATGCATTAGAATTCCTTGCGTCTATGTTCCTTGGATCTGAAAACAGTGCATAATGCAGGAGATTCCACCCAAAAGCTAACCCACAAGTCCAAGCTGAAGTGGAATATTTCGCAAAATTTGATCTACACTCACCCGATAGCTTTACTGCTAGAGAAAGGTTATTTTTTCACTTCATTATACTTTATAGAGAGAGATTGGGGGAGGGGGAGGGGGAGGGGGAGGGGTGAGGTGTAGCCACAAACCTGAATGGATAAGCTGTAGAACTGAAATTTCCAGTCATGTTACTTGCAATTTTAATGAATTACAGGATTTACGAACTGACATAATAACGATTTGGGTAAAAGTCTAAAAGATTCCAGTATTTTGAGGATATTTGTAATTACTATTCATAAAGTTGACCTGTTTCATAATGTCTCATGCTCACCCCCCTCCCCCCACCCCATCCACTTCATATCAGTTCTTAAAACATGTTGCAAATTATATATACATTGTAAGTTGGTAATAGAGAAAAATTGAGTGAGGTAAATGCAATACAAATCGAATCCATTATTAAGCAATTAAGACTTGTTCAGGTACGGCACGTGAACCTCCAACAAATTTCAAAAATGATGCAGTTTGGTTTTATGTGTAAAGTGAATGGCAACAAAGGACCTACCGGTGCGTGTCTTTGTATGTTTTGGACTGCGCAAATTCAGTGAGCTCTTTTTAATAATATACACTATGTAAAGCGTATTGAACTCTATGTCAGCATTTAAAAAACTCTGCGATTTTGACTGTTTTGCAGCATCATATCTGAGCAAGCCTTAACGGGACGTGGTAAAATTGTTCAGATGAGAGACAATTGTGCTAAGGTATTGACTTCAATGCTATATGTACACTTAAAGATAATCTGAAAGTTTGAGTGAAAAAAGACCATTATTGATGATAAAAATTGGGAACAACTGATCTGATCGATTCCTTAATTCTTCCAACTATATTATTATAATTTAATTTAATTTTAGGTGAATGTAAATCATCACAAAGAAAAGAATTGGCTCTAATACCTTAGATTTTTAAAGGCCTGTTTTATATCTTATTTTCATGGAAAAACGGTTGGGGGAAAATTCAAAAATTTATTGGGAGAATGAAGTGTTAAAGAGTGACACACAGTGGCGCCTTCAAAGAAAACCATAAATATCTTTGTGGTTTGAGAATTTTTTGGTAGTTAAAAGTATAAAATTCTTGGATTGTATCTGTGATTTTGAGAGCACTATATGGCTTACCTTTATTGAATTCGCTTTTAAAATTTAAGTTAAATTAATATTTTGTGAAACTCCCCCCAGGAGTTTCAAACGTGCCAAATGAATGTTGTGACATTAGCAATAGAATGTATCTCTTTGTGCTAAACTTGTTCAGCATGTTTGCTATTTTATCTTAAACTTGGAAATATCTTCTGAATAATTATTGCACAGTCACCTTGGAATTGCCCAACAAAGCCACTCGTACTGGCGGGAATGTTATCTGATAGAAATTGTATTTTTATACTTGAACTTCAGCTTCTGTATTTGCAACAATTTTTTTTGGATGATATTTATAAAATATGAATGTTGCCACTAATGCCTTTTCTTGTATTTAAGTCATGTGCCAGTAAGAAGCAGGTTTCTAGCACAGAAAATAGGTACAGTTGAGCTGATATCTGCACAGTTTTCCAATATGCTGTATCGCCAAATGTGAACATCGTGGTTTCAACGGGCAAGCAACCATCATCAGAAAACTCTGCAGGTATCAGTGAAGCTGTCCCTGTTCCCCTTGCTGCCAACTTGTTCCTTTTGAGTGTAAGAAATAACTTAGCTAAGCCATGTGTTTATCATTTGTGCCATTTTTCTCTTGTGTGTGATTTAGATTGTATAGTTTTATACTTTATACTGAATTATTGCCATAAACTTAGATATTCCCCTTGTATGTAACAAGTATTGATCTTTCATGCTCAGGAATTGTTTCCAACAACCTTTTGTTTTATGTTATAGTCTTTATCTGCATTAAAGTATTGGGGTTGTGAGGAGCAGTGTTGCAGCATGGAGAAGAAATAGAGCTGCACTGATGAATGCCCAGCTTTCCACTATGCTGTTTTGCTGAATATGAGGAACTTCCCCAGTCTGATGTTTTCTTGTCTACTAAACAACTGCGGGTATCAGTGTAGCTTTACCTAGTCTCTATGCTGCTAACCTGCTTCTCACAACCGCAAGACTTATAAGTTAAGCCAATATATATCATAGTTTCTTGTAACTGAATTAAATTTGAAATGAAATAGCACAATTTATAACGAAACAAATATCTTTGTGATGGCCTGTTAACTTTCTTAAAATCAATTATGAGACTGACAGAAATACACTAGGTATTTATACAGCATGTTTTGGAAGAAGTTTCAGGATTGTGATGGAAAGATTTTGTATTTATAGAAGACAAGTTAGATAGAAGAAGGTATAAACATAAGTATTCTATATTTTTATTATCCATTTTCATACCATATAAATGAACATTAAAAATATGAAAATTACTTTCTGTCTGGCATGTGTATATATTATGTGATGCAATATCTGTTGCTCTATTTTTACTGTGTGAATGTTCAGAATGTATTCATGAAGTGACTTTTACACTTTCTTCCTTCATCAGGTGGTCATATAGATGTCATTTAGAGGACACAAAAGACGTAAAGATCATGTAAGGATAAAAGGTACATCGAAATGACCAGTAAGATGTAAATATCACGTCAAAATTTGATGTCCATACAACGTATACACGACGTCTGTAGGACGTCTTTCTTGGGTAAAAGTTGACGTCTTAAAGACGTCTTTCTTGGACCAATAAGACCA	S. purpuratus

mRNAs based on gene models(0)

mRNAs from cDNA libraries (3)

Clone	Accession	Species	Library	Anatomy	Stage
	XR_004063556 >XR_004063556\|XR_004063556.1 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus uncharacterized LOC115922680 (LOC115922680), transcript variant X3, ncRNA CAAGACTATACATGCTCGCATCTAGTTTGCTATTTCAAACGGGAATGTGTACGTACGTGTGTGTACAGGTACATTCAGCACTCAAGGCAATGCGTAGGACTACAATGCATTGCATTGCACGATGTGTATGTAATGTATTTGAATTCAGAGTGAAAAAGCCGTTGCAAGAAGTATCCTCCTCCTGAATACTCCAGTTTTCTCCTGCAAATTTACAGTATGGGCATCTTTTTTTAACATCTTTCGTCAAAGAAGTGGATTCAAAGCACATTGTGGCCTCAGTATATTGATGTGAAACCATGCAGAAAATGCTACTTTCTCTCAACCTTGTGGATGTTCCCTACTTCCCTAAGGATCAGCAGCCTCTTGAAACAGGTGAAGCCATTATCGAATTCCTTGCGTCTATGTTCCTTGGATCTGAAAACAGTGCATAATGCAGGAGATTCCACCCAAAAGCTAACCCACAAGTCCAAGCTGAAGTGGAATATTTCGCAAAATTTGATCTACACTCACCCGATAGCTTTACTGCTAGAGAAAGGTGGTCATATAGATGTCATTTAGAGGACACAAAAGACGTAAAGATCATGTAAGGATAAAAGGTACATCGAAATGACCAGTAAGATGTAAATATCACGTCAAAATTTGATGTCCATACAACGTATACACGACGTCTGTAGGACGTCTTTCTTGGGTAAAAGTTGACGTCTTAAAGACGTCTTTCTTGGACCAATAAGACCA	S. purpuratus
	XR_004063552 >XR_004063552\|XR_004063552.1 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus uncharacterized LOC115922680 (LOC115922680), transcript variant X1, ncRNA AGACTATACATGCTCGCATCTAGTTTGCTATTTCAAACGGGAATGTGTACGTACGTGTGTGTACAGGTACATTCAGCACTCAAGGCAATGCGTAGGACTACAATGCATTGCATTGCACGATGTGTATGTAATGTATTTGAATTCAGAGTGAAAAAGCCGTTGCAAGAAGTATCCTCCTCCTGAATACTCCAGTTTTCTCCTGCAAATTTACAGTATGGGCATCTTTTTTTAACATCTTTCGTCAAAGAAGTGGATTCAAAGCACATTGTGGCCTCAGTATATTGATGTGAAACCATGCAGAAAATGCTACTTTCTCTCAACCTTGTGGATGTTCCCTACTTCCCTAAGGATCAGCAGCCTCTTGAAACAGGTGAAGCCATTATCGAATTCCTTGCGTCTATGTTCCTTGGATCTGAAAACAGTGCATAATGCAGGAGATTCCACCCAAAAGCTAACCCACAAGTCCAAGCTGAAGTGGAATATTTCGCAAAATTTGATCTACACTCACCCGATAGCTTTACTGCTAGAGAAAGGTTATTTTTTCACTTCATTATACTTTATAGAGAGAGATTGGGGGAGGGGGAGGGGGAGGGGGAGGGGTGAGGTGTAGCCACAAACCTGAATGGATAAGCTGTAGAACTGAAATTTCCAGTCATGTTACTTGCAATTTTAATGAATTACAGGATTTACGAACTGACATAATAACGATTTGGGTAAAAGTCTAAAAGATTCCAGTATTTTGAGGATATTTGTAATTACTATTCATAAAGTTGACCTGTTTCATAATGTCTCATGCTCACCCCCCTCCCCCCACCCCATCCACTTCATATCAGTTCTTAAAACATGTTGCAAATTATATATACATTGTAAGTTGGTAATAGAGAAAAATTGAGTGAGGTAAATGCAATACAAATCGAATCCATTATTAAGCAATTAAGACTTGTTCAGGTACGGCACGTGAACCTCCAACAAATTTCAAAAATGATGCAGTTTGGTTTTATGTGTAAAGTGAATG	S. purpuratus
	XR_004063553 >XR_004063553\|XR_004063553.1 PREDICTED: Strongylocentrotus purpuratus uncharacterized LOC115922680 (LOC115922680), transcript variant X2, ncRNA TATACATGCTCGCATCTAGTTTGCTATTTCAAACGGGAATGTGTACGTACGTGTGTGTACAGGTACATTCAGCACTCAAGGCAATGCGTAGGACTACAATGCATTGCATTGCACGATGTGTATGTAATGTATTTGAATTCAGAGTGAAAAAGCCGTTGCAAGAAGTATCCTCCTCCTGAATACTCCAGTTTTCTCCTGCAAATTTACAGTATGGGCATCTTTTTTTAACATCTTTCGTCAAAGAAGTGGATTCAAAGCACATTGTGGCCTCAGTATATTGATGTGAAACCATGCAGAAAATGCTACTTTCTCTCAACCTTGTGGATGTTCCCTACTTCCCTAAGGATCAGCAGCCTCTTGAAACAGAATTCCTTGCGTCTATGTTCCTTGGATCTGAAAACAGTGCATAATGCAGGAGATTCCACCCAAAAGCTAACCCACAAGTCCAAGCTGAAGTGGAATATTTCGCAAAATTTGATCTACACTCACCCGATAGCTTTACTGCTAGAGAAAGGTTATTTTTTCACTTCATTATACTTTATAGAGAGAGATTGGGGGAGGGGGAGGGGGAGGGGGAGGGGTGAGGTGTAGCCACAAACCTGAATGGATAAGCTGTAGAACTGAAATTTCCAGTCATGTTACTTGCAATTTTAATGAATTACAGGATTTACGAACTGACATAATAACGATTTGGGTAAAAGTCTAAAAGATTCCAGTATTTTGAGGATATTTGTAATTACTATTCATAAAGTTGACCTGTTTCATAATGTCTCATGCTCACCCCCCTCCCCCCACCCCATCCACTTCATATCAGTTCTTAAAACATGTTGCAAATTATATATACATTGTAAGTTGGTAATAGAGAAAAATTGAGTGAGGTAAATGCAATACAAATCGAATCCATTATTAAGCAATTAAGACTTGTTCAGGTACGGCACGTGAACCTCCAACAAATTTCAAAAATGATGCAGTTTGGTTTTATGTGTAAAGTGAATG	S. purpuratus

ESTs (0)